T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=83
*
 BAD AVG GOOD
*
C.owczarzaki     :  89
H.sapiens        :  85
A.gambiae        :  81
C.intestinalis   :  82
C.reinhardtii    :  74
M.musculus       :  87
cons             :  83

C.owczarzaki     ------------------DKK------------------------
H.sapiens        MAPRGRKRKAEAAVVAVAEKRE---------KLAN-----GGE--
A.gambiae        MAPR-RKRAAAAKSTETAAKKAKPEESA-STPVE----------E
C.intestinalis   MARKARKRKSAAAEAEIAGEISVSEN-VKPEKVDQVNDEPYAKTK
C.reinhardtii    MAPK-RKAAAAA--EAPAKKAKAPAKKKEAEKKEET--A---PVA
M.musculus       MAPHGRKRKAGAAPMETVDKRE---------KLA-----------

cons                                :                         


C.owczarzaki     PRLGLRFVIERCNSXRTYASRANGLRDTLQEAFPDAEIL--IN-P
H.sapiens        GMEEATVVIEHCTSURVYGRNAAALSQALRLEAPELPVK--VN-P
A.gambiae        SQDGAYVFIEHCKSUSVFKRKAAEVHSGLCELAPEHKFQLVLNED
C.intestinalis   KEDMVQLKIEHCKSURVYGRNAQLVLDALQTVEPNLSSS--IN-P
C.reinhardtii    ADAGDGIVIEACKSUGAFKTRATKLEKLIKEGAPGTSVS--VN-P
M.musculus       --EGATVVIEHCTSURVYGRHAAALSQALQLEAPELPVQ--VN-P

cons                   . ** *.*  .:  .*  : . :    *       :*  


C.owczarzaki     NKPRRGSFECTMQL--GGAESLVWTGVKRGPPRNDKFPDGAKLVA
H.sapiens        TKPRRGSFEVTLLR-PDGSSAELWTGIKKGPPRKLKFPEPQEVVE
A.gambiae        GKPRRGAFEVSIAKGKDGEKVLVWSGLPKGPPRKDKFPEPKTILD
C.intestinalis   TKPRSKSFEVSIVK--DGIETVIWSGVKKGPPRKLKFPSKEEIIE
C.reinhardtii    DKPRKGCFEVR---GPGGKTFVSLLD-MPRPFTKLKALDVEALAE
M.musculus       SKPRRGSFEVTLLR-SDNSRVELWTGIKKGPPRKLKFPEPQEVVE

cons              ***  .**       ..       .    *  : *  .   :  


C.owczarzaki     DIRQ---LIQ
H.sapiens        ELKK---YLS
A.gambiae        DVL--KVLKN
C.intestinalis   CFQNAECVKK
C.reinhardtii    EVL--AALKE
M.musculus       ELKK---YLS

cons              .       .