Phaeodactylum tricornutum

Query	tBLASTn extès	tBLASTn filtres	Hits (e-value)	Exonerate	Localització dels exons	cDNA	Proteïna	GeneWise	TCoffee	BLASTp	Elements SECIS
Fep15 D.rerio	Veure	Veure	0.010	Veure	-	-	-	Veure	GeneWise	GeneWise	-
Fep15 S.salar	Veure	Veure	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Fep15 O.mykiss	Veure	Veure	0.23	Veure	-	-	-	Veure	GeneWise	GeneWise	-
Fep15 O.latipes	Veure	Veure	0.041	Veure	-	-	-	Veure	GeneWise	GeneWise	-

Al realitzar el tBLASTn emprant les diferents querys de Fep15, hem obtingut uns alineaments amb E-values poc significatius però on la selenocisteïna de les querys es troba alineada amb codons TGA. Per aquest motiu, hem decidit continuar amb l'anàlisi de les seqüències. A continuació, hem reduït la regió d’alineament i hem dut a terme el programa Exonerate, que no ens ha reportat cap resultat. Per aquest motiu, hem decidit utilitzar el progama GeneWise per intentar aconseguir un resultat millor. En aquest cas sí que hem obtingut un alineament però tot i així, la selenocisteïna no es troba alineada. A més, hem observat que aquest alineament només correspon a un petit domini que segurament es troba conservat entre les querys i una altra proteïna del genoma de P.tricornutum, però que en cap cas es tracta de la selenoproteïna o homòleg en cisteïna que estem cercant.