Cryptosporidium parvum
(e-value) |
|||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
En aquest genoma només hem aconseguit valors per a la query sbp2 utilitzant l'Exonerate, tot i que la proteïna obtinguda és de mida molt reduïda en comparació a la query. La regió que s'alinea d'aquestes mitjançant el TCoffee presenta valors de similiaritat bons. A més, la regió Ribosomal-L7Ae, que creiem que és determinant per la funcionalitat de la sbp2, queda ben alineada amb la proteïna obtinguda.(veure alineament múltiple amb els motius funcionals: sbp2) També hem executat el programa GeneWise per aquesta query i els valors que hem obtingut han estat similars. Tot i obtenir una proteïna tant petita el domini funcional s'alinea amb aquesta, i per tant pensem que possiblement sbp2 es troba en C. parvum.
Quan hem executat el GeneWise també hem obtingut resultats significatius mitjançant les querys eEFSec i SECp43. Per les proteïnes obtingudes amb ambdues querys, el Tcoffee ens ha reportat alineaments amb valors de similiaritat alts i, a més a més, hem vist que aquestes presenten els dominis amb què hem restringit la funcionalitat de les querys usades (unió a GTP i SelB per eEFSec i RRM per SECp43) (veure alineament múltiple amb els motius funcionals:eEFSec i SECp43).