SelP:
Per descarregar un arxiu comprimit amb tots els resultats obtinguts de la SelP premeu aquest botó:
Procès:
1.- Genoma protists: proporcionat per l'assignatura
2.- Seqüència selenoproteïna P: SelenoDB i NCBI
3.- Realizació tBLASTN
Query: Selenoproteïna P, H. sapiens (vertebrat, proteïna sencera)
Selenoproteïna P, K. owalevskii (Ascídia, proteïna només amb el primer domini)
Database: Genomes dels protists
4. Resultats tBLASTN:
4.1 Selenoproteïna P, H. sapiens:
Cap E-value significatiu (menor de 10-4)
*E-value de 0,006 en N. gruberi, no coincidència en zona de Sec pero sí després durant el primer domini. Es valora la possibilitat de que sigui un precursor (Per a més informació mirar Discussió).
*Coincidència de U con C en K. owczarzaki en un fragment del segón domini (relacionat amb el transport de seleni en vertebrats) (Per a més informació mirar Discussió)
.
4.2 Selenoproteïna P, K. owalevskii
Cap E-value significatiu (menor de 10-4)
Cap alineament d'interès.
Per a més informació:
