SelL:
Per descarregar un arxiu comprimit amb tots els resultats obtinguts de la SelL premeu aquest botó:
Procès:
1.- Genoma protists: proporcionat per l'assignatura
2.- Seqüència selenoproteïna L: NCBI
3.- Realització tBLASTN
Query: Selenoproteïna L, S. salar
Database: Genomes dels protists
4.-Resultats tBLASTN
Selenoproteïna L, S. salar
Cap E-value significatiu (menor de 10-4)
*E-value de 0,001 en C. owczarzaki: Coincidència del motiu UxxU amb motiu CxxC. Correspondència amb el domini Trx_like (Shchedrina et al 2007) però no amb la resta de la proteïna (Per a més informació mirar Discussió).
Query: 148 KGENLLLVLIRHFGULPUREHVAELATQQGLLDSQSARVLVISFGCREGAQIWLDQT--- 204 K + +LL+L+R FG E + + + LD+ +++++ G R A+ +++ Sbjct: 1144270 KDQRVLLILLRRFGCSLCHEQASHVLEIKPQLDAAGVKIVLVGTGNRYFAEKFIENVPGN 1144091 * * Query: 205 GCKY--DMLLDPERKIYKAFGLGSSYSNVMNFDSLLQYAEYVVLGQEFPDIPPRFLEDFY 262 G ++ ++ +DPE+ YKA GL +++F S +E+ + P+ D Sbjct: 1144090 GQRFPAEVYIDPEQTAYKARGL--QRVGLLHFLSWTAISEWRKANKNHPNAD--LQGDGL 1143923 Query: 263 QMGGDFVLDEGGTVILSHPCKNPMDRP 289 Q GG +++ G + H N D P Sbjct: 1143922 QTGGIYLVGPGADSAI-HFAFNEYDHP 1143845
*E-value de 0,14 en C. merolae: Coincidència del motiu UxxU amb motiu CxxC. Correspondència amb el domini Trx_like (Shchedrina et al 2007) però no amb la resta de la proteïna (Per a més informació mirar Discussió).
Query: 153 LLVLIRHFGULPUREHVAELAT-QQGLLDSQSARVLVISFGCREGA-----QIWLDQTGC 206 L++ RHFG + R V ELA +Q + R++VI G E A L Sbjct: 387229 LVIWPRHFGCVLCRRLVKELAAREQAFRQERKWRLMVIGCGTPEQAAKFRTDATLGPLPA 387408 * * Query: 207 KYDMLLDPERKIYKAFGLGSSYSNVMNFDSLLQYAEYVVLG--QEFPDIPPRFLEDFYQM 264 + DP R+ Y A + N +L + G Q + IPP D +Q Sbjct: 387409 SIPVYTDPLRRSYLALRFRRGILSTFNLPALQNILDSFQKGERQRWDMIPP----DAFQQ 387576 Query: 265 GG 266 GG Sbjct: 387577 GG 387582
Per a més informació:
