Methionine sulfoxide reductase A - Msr A -
Alineament general: tBLASTn
SELENOPROTEÏNES:
Scaffold 4
- Exonerate
- Genewise
- Gff
- Seqüència d'aminoàcids
- T-COFFEE
- Interpro
- Elements SECIS 1
- Elements SECIS 1 (imatge)
- Elements SECIS 2
- Elements SECIS 2 (imatge)
Scaffold 5
- Genewise
- Gff
- Seqüència d'aminoàcids
- T-COFFEE
- Interpro
- Elements SECIS 1
- Elements SECIS 1 (imatge)
- Elements SECIS 2
- Elements SECIS 2 (imatge)
Scaffold 7
- Exonerate
- Genewise
- Gff
- Seqüència d'aminoàcids
- T-COFFEE
- Interpro
- Elements SECIS
- Elements SECIS (imatge)
Scaffold 41
- Exonerate
- Genewise
- Gff
- Seqüència d'aminoàcids
- T-COFFEE
- Interpro
- Elements SECIS
- Elements SECIS (imatge)
Tornar a dalt
HOMÒLEGS AMB CISTEÏNA:
Scaffold 1
Scaffold 2
Scaffold 13
Scaffold 14
Tornar a dalt
HOMÒLEGS AMB TIROSINA:
Scaffold 3
Scaffold 15
Tornar a dalt
Ens ha cridat l'atenció el fet d'obtenir tantes possibles còpies de MsrA. Hem comprovat que les seqüències que codifiquen són totes diferents i, per tant, no es tracta d'errors en la seqüenciació del genoma. Per tal de comprovar-ho vam fer un T-COFFEE; a partir d'aquí hem deduit que tenim 4 còpies de MsrA amb selenocisteïna, 4 homòlogues amb cisteïna i 2 homòlogues amb tirosina.