Les proteïnes TR controlen l’estat de reducció de les tioredoxines, proteïnes involucrades en la regulació de les reaccions redox dels processos cel·lulars. N’existeixen tres tipus en mamífers: TR1 que és citosòlica, TR3 que és mitrocondrial, i TR2.
TR1
Al blast d'aquesta proteïna es troben quatre possibles regions en humà i tres en ratolí. L'scaffold seleccionat és gi|385726818|gb|JH655910.1| té un E-value de 6,00E-29 en humà i de 1,00E-28 en ratolí i una puntuació de t-coffee de 99 punts en humans i 67 punts en ratolí. La diferència entre les dues espècies analitzades és notable, per tant s'utilitzen les dades proporcionades per la seqüència humana. El sentit de l'anotació és antisense (-) i va de la posició 135579 a la 41362.
En l'estructura predita per l'exonerate en l'humà, mostra 23 exons i 22 introns. A l'últim exó de la proteïna hi trobem una selenocisteïna aliniada amb un codó stop del genoma de Condylura.
En la predicció d'elements SECIs s'ha trobat un SECI amb els dos mètodes de búsqueda. Aquest, està en posició 3' i de grau A. Per tant, la proteïna TR1 és una selenoproteïna present en el genoma de Condylura Cristata.
TR2
Com s'ha comentat anteriorment hi ha tres tipus de proteïnes TR en mamífers, tot i això, s'ha vist que el genoma de Condylura és una excepció ja que només hem trobat duesFhu proteïnes d'aquesta família.
En el blast de TR2 s'observen quatre regions candidates a ser l'scaffold seleccionat tant en humà com en ratolí. Finalment es selecciona el gi|385726847|gb|JH655881.1| amb un E-value de 1,00E-22 en humà i 5,00E-17 en ratolí. Les puntuacions del t-coffee són en els dos casos de 99 punts. El sentit de l'anotació és antisense (-) i està entre els nucleòtids 67151 i 32105.
En l'estructura de la proteïna que prediu l'exonerate hi apareixen 16 exons i 15 introns en les dos espècies. A l'últim exó de la proteïna s'hi troba una selenocisteïna que al genoma de Condylura està aliniada amb un codó stop.
S'han predit dos element SECIs. El primer, de grau A està en posició 3' i el segon, de grau B està en posició 5' per tant es selecciona el primer element SECI. Amb tota la informació anterior es confirma que la proteïna TR2 és una selenoproteïna present en el genoma de Condylura.
