Conclusió

En aquest estudi no hem pogut trobar selenoproteïnes de la familia SelQ.

D'altra banda, hem trobat la selenoproteïna DI als organismes: D.discoideum_AX4, D.fasciculatum i P.polycephalum. A aquests organismes també hem trobat el SECIS i la maquinària de transcripció (a excepció del tRNASec). En humans hem trobat a SelenoDB tres membres de la familia DI, però en aquests organismes només hem trobat un sol membre, fet que ens fa pensar que en H.sapiens s'han produït duplicacions de DI, obtenint-se així diferents paràlegs. Les proteïnes predites són relativament similars, tot i que exonerate ens ha predit una estructura exónica diferent. A D.discoideum_AX4 trobem un únic exó, a D.fasciculatum està format per 3 exons, i a P.polycephalum per 2 exons.

Gràcies a Selenoprofiles, hem trobat una segona selenoproteïna DI al organisme P.polycephalum. Aquests resultats els hem contrastat amb la nostra metodologia inicial. En aquest cas, es tracta d'una proteïna formada per 3 exons. Tant el gff com el T-coffee poden ser trobats a l'apartat a Selenoprofiles de la discussió.

Entre els genomes dels protistes estudiats no hem trobat cap SelJ, i només en un cas, en P.capsici, hem trobat un homòleg en cisteïna d'aquesta selenoproteïna. En A.laibachii, C.fasciculata, L.donovani, L.tarentolae i T.congolense hem predit proteïnes hipotètiques que pertanyen a la família d'ADP-ribosiladors, igual que SelJ i CrystallinJ1, ja que comparteixen amb aquestes el domini característic de la família.

* Aquests hits homòlegs en serina i cisteïna han estat predits amb Selenoprofiles 2.2.