RESULTATS
selk - Phytophthora capsici
| Queries | Tblastn | Fastafetch | Fastasubseq | Exonerate | Genewise | cDNA | Proteïnes | T-coffee | Blastp | Secis |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| D.melanogaster |  |
 |
|
|
|
|
|
|
|
|
| A.gambiae | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| H.sapiens |  |
|
|
|
|
|
|
|
|
:[5695,5785].png) |
| L.braziliensis | |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Resultats positius | | Resultats negatius | | No resultats |
En aquest cas, el tblastn ha sortit significatiu per la query de H.sapiens (e-value = 2-5) Al realitzar l'anàlisi entre query i genoma amb l'exonerate s'obté un bon alineament. Amb l'anàlisi mitjançant genewise l'alineament no s'ha considerat òptim, i per això s'han escollit les regions alineades per l'exonerate. El cDNA s'ha extret i traduït correctament. En el t-coffee s'ha trobat que la selenocisteïna no s'ha alineat correctament amb el codó STOP trobat a la pauta de lectura més adequada. També s'ha trobat un resultat de blastp positiu, pel que és gairebé segur que hi ha proteïnes d'aquesta familia en altres organismes. A més, aquest organisme presenta elements SECIS en el seu genoma.