*SELENOPROTEINES EN PROTISTES*

RESULTATS

selk - Leishmania tarentolae

Queries Tblastn Fastafetch Fastasubseq Exonerate Genewise cDNA Proteïnes T-coffee Blastp Secis
D.melanogaster
A.gambiae
H.sapiens
L.braziliensis
Resultats positius   Resultats negatius   No resultats  

En aquest cas, el tblastn ha sortit significatiu amb la query de L.braziliensis (e-value = 4-38). Al realitzar l'anàlisi entre la query i el genoma amb el genewise s'obté un alineament que tot i ser curt, l'hem tirat endavant. Contràriament, l'anàlisi amb l'exonerate no resulta adhient i s'ha descartat. El cDNA s'ha extret i traduït correctament. En el t-coffee s'ha trobat que la selenocisteïna de la query s'ha alineat amb una cisteïna, fet que indica que la proteïna de L.donovani es tracta d'un homòleg de cisteïna. Per aquesta query, per altra banda, el resultat del blastp ha estat negatiu. Per últim, aquest organisme no presenta elements SECIS en el seu genoma.