P.ultimum
En el tBLASTn observem que el primer hit té un E-value significatiu (4e-21) i, a més a més, observem que la selenocisteïna de la nostra query es troba alineada amb una cisteïna del genoma de P.ultimum, fet que ens porta a pensar que podríem estar davant d’una proteïna homòloga en cisteïna.
Vam continuar amb el procediment explicat a materials i mètodes fins a obtenir la seqüència proteica. A continuació vam realitzar un alineament amb el t-coffee, on s’observa la presència de la cisteïna de P.ultimum alineada amb la selenocisteïna de la query.
Per confirmar que es tractava d’una proteïna homòloga en cisteïna, hem realitzat un pBLAST a la pàgina web de NCBI, obtenint així que es tracta d’una proteïna de la família de les Disulfit Isomerasses (PDI). Aquesta família és la homòloga a la selenoproteïna EhSEP2, i té un domini tioredoxina molt conservat.
Finalment, vam fer la cerca d’elements SECIS a través de la pàgina web SECISearch, però no en vam trobar cap de significatiu.