P.tricornutum

Tal com veiem en el tBLASTn, té diversos hits significatius. Només el tercer hit (4e-13) tenia la selenocisteïna alineada amb una cisteïna del nostre genoma. Per aquest motiu vam realitzar tot el procediment explicat a materials i mètodes amb el primer (7e-32) i el tercer hit. Quan realitzavem el t-coffee, l’alineament amb la proteïna obtinguda a partir del primer hit era millor, per la qual cosa vam decidir que la nostra proteïna homòloga era aquesta (veure resultats).

Per confirmar aquesta teoria, hem realitzat un pBLAST a la pàgina web de NCBI, obtenint així que es tracta d’una proteïna de la família de les Disulfit Isomerasses (PDI). Aquesta família és la homòloga a la selenoproteïna EhSEP2, i té un domini tioredoxina molt conservat.

Finalment, vam fer la cerca d’elements SECIS a través de la pàgina web SECISearch, però no en vam trobar cap de significatiu.

Tornar a la taula