C.owczarzaki

En el tBLASTn observem que el primer hit té un E-value significatiu (1e-17) i, a més a més, observem que la selenocisteïna de la nostra query es troba alineada amb una cisteïna en el genoma de C.owczarzaki , fet que ens porta a pensar que podríem estar davant d’una proteïna homòloga en cisteïna.

Vam continuar amb el procediment explicat a materials i mètodes fins a obtenir la seqüència proteica. A continuació vam realitzar un alineament amb el t-coffee, on s’observa la presència de la cisteïna de C.owczarzaki alineada amb la selenocisteïna de la query. Per confirmar que es tractava d’una proteïna homòloga en cisteïna, hem realitzat un pBLAST a la pàgina web de NCBI, obtenint així que es tractava d’una proteïna de la família de les Disulfit Isomerasses (PDI). Aquesta família és la homòloga a la selenoproteïna EhSEP2, i té un domini tioredoxina molt conservat.

Finalment, vam fer la cerca d’elements SECIS a través de la pàgina web SECISearch, però no en vam trobar cap de significatiu.

Tornar a la taula