E.siliculosus

Aquest cas és especial ja que la query que fem servir és la de la SelO d'aquest organisme. Per tant, a priori ja sabíem que E.siliculosus posseïa una proteïna homòloga amb cisteïna. Tot i així hem comprovat la presència d'aquesta proteïna en el genoma seguint els passos especificats en l'apartat de materials i mètodes (veure fitxers a la taula).

Com era d'esperar la proteïna es present en el genoma i en conseqüència, hem verificat l'autenticitat de la query.

Cal mencionar, que tot i que vam realitzar el procés amb la query del mateix del mateix organisme, i obtenir un BLAST perfecte, per tal d’obtenir la proteïna final, vam haver de repetir el procés d’extracció de la regió varies vegades, ja que només obteniem part de la proteïna, i ens mancaven els últims exons. Per tal, d’aconseguir extreure tota la proteïna, vam ampliar els marges, per finalment conseguir extreure-la i obtenir un alineament perfecte.

A continuació vam fer la cerca d’elements SECIS, però no vam poder determinar-ne cap de significatiu amb les eines que disposem.

Tornar a la taula