Selenoproteïna K - SelK -

Alineament general: tBLASTn

SELENOPROTEÏNES:

Scaffold 8


Tal i com es pot apreciar en l'alineament realitzat amb el genewise, el programa ens ha alineat la selenocisteïna de la SelK de Chlamydomonas amb una alanina del tros de genoma d'A. anophagefferens ( scaffold 8). Com és poc probable que es tracti d'un homòleg amb alanina, hem continuat mirant el scaffold 8 més enllà de l'últim aminoàcid alineat. Per això ens hem ajudat del programa Expasy per traduir la seqüència nucleotídica en aminoacídica. Sorprenenment, hem comprovat que després de 22 aminoàcids des de l'alanina hi ha un codó U (TGA) seguit d'una G i un codó STOP (TAG). Així, doncs hem allargat la seqüència candidata a codificar per la SelK en A. anophagefferens fins al codó stop, incloent la selenocisteïna. Genewise modificat