Abstract | Introducció | Materials i Mètodes | Resultats | Discussió | Bibliografia |
Les selenoproteïnes són proteïnes que han estat identificades en bacteris, Archaea i eucariotes, i es caracteritzen per incorporar l'aminoàcid selenocisteïna, un anàlog de la cisteïna en el que l'àtom de seleni es troba en el lloc del sulfur. Molts components de la maquinària de síntesi de les selenoproteïnes estan conservats en diferents espècies, suggerint que les selenoproteïnes tenen un paper important en la funció cel·lular (Low and Berry, 1996; Stadman, 1996). Les selenoproteïnes procariotes estan involucrades en processos catabòlics i en la utilització del seleni per catalitzar diverses reaccions redox (Stadtman, 1996). Contràriament, les d'eucariotes participen en reaccions anabòliques d'oxido-reducció i funcionen com a antioxidants. És a dir, participen en el control del balanç redox cel·lular evitant els possibles efectes danyins que una alteració del mateix pot causar (Gladyshev i Kryukov, 2001).
La incorporació de selenocisteïna en les selenoproteïnes requereix un pas inusual en que el codó UGA, que normalment és un codó stop especifica la inserció de selenocisteïna . Per tant, en un sol mRNA, l'UGA pot tenir dos significats: stop o selenocisteïna . La recodificació del codó UGA es dóna per un mRNA d'estructura secundària/terciària (element SECIS), el qual es localitza en la regió 3'UTR en eucariotes.
El gen que codifica per la selenoproteïna està interrumput per un codó TGA dins la pauta de lectura i a més, conté un element SECIS que es troba entre uns 500-4000 parells de bases downstream de distància respecte la regió codificant de la selenoproteïna. La imatge següent mostra la seva estructura:
Paramecium tetraurelia és un eucariota unicel·lular ciliat de gran tamany (120 µm) que pertany al fílum dels Ciliats. Aquests organismes tenen dos nuclis, diferents en estructura i funció:
Un micronucli diploid que representa la línia germinal i és inactiu en termes de la transcripció. Pateix meiosi i fertilització durant els esdeveniments sexuals (conjugació o autogàmia).
Un macronucli poliploid que representa la línia somàtica, és el lloc de transcripció. A cada nova generació, es produeix un nou macronucli degut a reorganitzacions programades del genoma micronulear complet.
La major part de l'heterocromatina és eliminada, incluïnt les seqüències repetides, durant el desenvolupament del macronucli, pel qual el seu genoma és molt compacte (fracció codificant del 70% aproximadament). Els introns són petits (18-35 bases) igual que les regions intergèniques. Aquestes característiques faciliten l'estudi del seu genoma.
En la taula següent, es resumeix la taxonomia a la qual pertany Paramecium tetraurelia :
REGNE | Protistes |
FÍLUM | Cilophora |
CLASSE | Oligohymenophorea |
ORDRE | Peniculida |
FAMÍLIA | Parameciidae |
GÈNERE | Paramecium |
Una altra característica d'aquest organisme és que presenta un codi genètic diferent a l'estàndard. El codi numèric estàndard és 1 (cóm és el cas dels humans), però en canvi, el de Paramecium tetraurelia és 6. Els canvis que el diferencien de l'estàndard són els següents:
Code 6 Standard UAA Gln Q Ter * UAG Gln Q Ter *
Com podem veure, dos dels codons que són codons Stop en humans (i en tots els altres organismes que tenen codi genètic 1, codifiquen per Gln (glutamina) en Paramecium tetraurelia . Així doncs, aquest microorganisme nomé té un sol codó Stop: TGA.