Abstract | Introducció | Materials i Mètodes | Resultats | Discussió | Bibliografia |
L'objectiu principal d'aquest treball de recerca consisteix en trobar selenoproteïnes en el genoma de Paramecium tetraurelia homòlogues a les selenoproteïnes humanes. Les selenoproteïnes són proteïnes que es caracteritzen per incorporar l'aminoàcid selenocisteïna, un anàleg de la cisteïna en el que l'àtom de seleni es troba en el lloc del sulfur. Molts components de la maquinària de síntesi de les selenoproteïnes estan conservats en diferents espècies, suggerint que les selenoproteïnes tenen un paper important en la funció cel·lular (Low and Berry, 1996; Stadman, 1996). A més a més de trobar selenoproteïnes en Paramecium tetraurelia , altres objectius importants realitzats han estat la correcta utilització i funcionament de diferents programes de genòmica com són el blast, el genewise, l'exonerate, el SECISearch, etc. A pesar dels obstacles que hem tingut a l'hora de trobar les selenoproteïnes perquè el nostre organisme té un codi genètic diferent de l'estàndard, hem obtingut uns resultats força satisfactoris. Les selenoproteïnes trobades en Paramecium tetraurelia és una selenoproteïna de la de la família DI ( Iodothyronine deiodinase) i una altra de la família TR (Thioredoxin reductase). Hem trobat també dues proteïnes homòlogues en cisteïna: la Gpx4 i la SelR1.
The main objective of this project consisted in finding selenoproteins on the genome of Paramecium tereaurelia that are homologues to those in humans. The selenoproteins are proteins that are characterized for incorporating the selenocysteine aminoacid, an analogue to cysteine in which selenium's atom occupies the place of sulphur. Many enzymes required for selenoprotein synthesis are conserved in different species, a fact that suggests that these proteins may have an important role on the cellular function (Low and Berry, 1996; Stadman, 1996). Other important objectives besides finding selenoproteins included the proper use and operation of several genomic programs, such as BLAST, GeneWise, Exonerate, SECISearch , etc. In spite of the obstacles we encountered when searching for the selenoproteins, due to the fact that Paramecium tetraurelia has a genetic code different from standard, we obtained satisfactory results. Selenoproteins found in this organism include a member of the DI family (Iodothyronine deiodinase) and another protein from the TR family (Thioredoxine reductase). We also found 2 ciysteine homologue proteins: Gpx4 and SelR1.
Indiscutiblement, la realització d'aquest projecte ha estat força intensa. Les hores dedicades no han estat suficients com per poder anar més enllà dels nostres objectius. Però la feina feta, feta està. Tot i així, estem molt orgulloses i satisfetes amb els resultats aconseguits. A més, hem tingut l'oportunitat de familiaritzar-nos com les qui més amb la Bioinformàtica.
D'altra banda, tampoc ens agradaria oblidar-nos de la col·laboració que hem rebut per part de tots els professors de l'assignatura; en especial, la del nostre tutor, en Nicolás Bellora, i la d'en Charles Chapple. Sense ells, més de la meitat de la nostra infinitat de dubtes no s'haguessin pogut resoldre.