L’objectiu principal d’aquest estudi és determinar els gens que s’encarreguen de sintetitzar les selenoproteïnes i la maquinària necesària per a la biosíntesi d’aquestes a Xiphophorus hellerii. Després d’analitzar el genoma d’aquesta espècie, s’ha fet una taula en la què es mostren els resultats de l’estudi. L’informació que queda plasmada a la taula és:
- Nom de les selenoproteïnes i proteïnes que participen en la síntesi d’aquestes
- Espècie amb la què s’ha comparat el genoma de X. hellerii, en aquest cas Danio rerio (peix zebra)
- Aminoàcid que conté l’espècie de referència i el què presenta X. hellerii (Selenocisteïna: S; Cisteïna: C,)
- Hits trobats pel tBLASTn, en cas d’haver-ne
- Fitxer exonerate
- Nom de l’scaffold. En cas de que hi hagi més d’u, es mostren tots
- Localització del gen predit: principi del primer exó i final de l’últim. Cadena a la què es troba: forward (+) o reverse (-)
- Nombre d’exons del gen predit
- Aliniament del t-coffee
- Predicció de la selenoproteïna
- Predicció del SECIS
A la següent taula es presenten els resultats obtinguts en la comparació del genoma de Xiphophorus hellerii amb les selenoproteïnes i proteïnes de maquinària de Danio rerio.
A la llegenda s'indiquen la correpsondència de cada icona.
Trobat
No trobat