Manis javanica

Abstract

Las selenoproteínas son un grupo de proteínas que contienen como mínimo un aminoácido conocido como selenocisteína (Sec). La estructura de este es la de una cisteína, en la que el átomo de azufre del grupo tiol ha sido substituido por uno de selenio. A diferencia del resto de aminoácidos, este no se almacena en el interior de las células debido al peligro que supone su elevada reactividad, sino que lo hace en forma de H2Se (forma menos reactiva). Para su síntesis es necesario el selenio de este pool y una maquinaria proteica que permite el reconocimiento del codón UGA como Sec, en lugar de codón de terminación. Es esta dualidad del codón UGA que dificulta el estudio de las selenoproteínas, provocando errores en la notación de proteínas de varias especies. Por este motivo se han desarrollado herramientas in silico que permiten su reconocimiento en genomas de especies que acaban de ser secuenciados. En este estudio hemos caracterizado las selenoproteínas de la especie Manis javanica por comparación con el genoma de una especie cercana como es Homo sapiens. Nuestros resultados muestran un total de 21 selenoproteínas, 5 homólogos en cisteína y 7 proteínas implicadas en la maquinaria de síntesis. Esto representa una pérdida de selenoproteínas y homólogos en cisteína y el mismo nĂºmero de proteínas implicadas en la maquinaria de síntesis. Este proyecto supone, pues, una aproximación filogenética de algunas familias de selenoproteínas del genoma de Manis javanica.