Abstract
Les selenoproteïnes són un grup de proteïnes que contenen com a mínim un aminoàcid anomenat selenocisteïna (Sec). L’estructura d’aquest és la d’una cisteïna, en la qual s’ha substituït l’àtom de sofre del grup tiol, per un de seleni. A diferència de la resta d’aminoàcids, aquest no s’acumula a l’interior cel·lular donat el perill que comporta la seva elevada reactivitat, sinó que ho fa en forma de H2Se (forma menys reactiva). Per a la seva síntesi es requereix el seleni d’aquest pool i una maquinària proteica que permeti el reconeixement del codó UGA com a Sec, enlloc de codó de finalització. És aquesta dualitat del codó UGA que dificulta l’estudi de les selenoproteïnes, provocant errors en l’anotació de proteïnes de diverses espècies. Per aquest motiu s’han desenvolupat eines in silico que permeten el seu reconeixement en genomes d’espècies que acaben de ser seqüenciats. En aquest estudi hem caracteritzat les selenoproteïnes de l’espècie Manis javanica, per comparació amb el genoma d’una espècie propera com és l’Homo sapiens. Els nostres resultats mostren un total de 21 selenoproteïnes, 5 homòlegs en cisteïna i 7 proteïnes implicades en la maquinària de síntesi.Això representa una pèrdua de selenoproteïnes i homòlegs en cisteïna i el mateix nombre de proteïnes implicades en la maquinària de síntesi. Aquest projecte suposa, doncs, una aproximació filogenètica d’algunes famílies de selenoproteïnes del genoma de Manis javanica.