RESULTATS
Selenoproteïnes
Família | Subfamília | Espècie | ID | TBLASTN | Scaffold | Exonerate | Genewise | Seqüència | t-coffee | Aliniament | SECIS | SEBLASTIAN |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DI | ||||||||||||
DI1 | Equus caballus | SPP00000849 | KK954861.1 | 2616-18865 (+) | Genewise | Sec amb Sec | ||||||
DI2 | Equus caballus | SPP00000850 | KK949927.1 | 783350-791910 (+) | Genewise | Sec amb Sec | ||||||
DI3 | Homo sapiens | SPP00000016 | KK958152.1 | ??? (+) | Exonerate Genewise |
Sec amb ? | ||||||
DI3 | Equus caballus | SPP00000851 | KK958152.1 | ??? (+) | Exonerate | Sec amb ? | ||||||
GPx | ||||||||||||
GPx1 | Equus caballus | SPP00000859 | KK950679.1 | 321034-321928 (-) | Genewise | Sec amb Sec | ||||||
GPx2 | Equus caballus | SPP00000852 | KK950321.1 | 740531-743611 (+) | Genewise | Sec amb Sec | ||||||
GPx3 | Equus caballus | SPP00000853 | KK950207.1 | 205043-207525 (-) | Genewise | Sec amb Sec | ||||||
GPx5 | Equus caballus | SPP00000854 | KK954756.1 | 64717-70016 (+) | Exonerate | Cys amb Cys | ||||||
GPx6 | Equus caballus | SPP00000855 | KK954756.1 | 29349-35881 (-) | Exonerate | Sec amb Sec | ||||||
GPx7 | Equus caballus | SPP00000856 | KK951541.1 | 29349-35881 (-) | Exonerate | Cys amb Cys | ||||||
GPx8 | Equus caballus | SPP00000857 | KK951636.1 | 117449-120956 (+) | Exonerate | Cys amb Cys | ||||||
GPx None | Equus caballus | SPP00000858 | KK953591.1 | 156367-156516(-) | Exonerate | Sec amb Sec | ||||||
GPx None | Equus caballus | SPP00000860 | KK952105.1 | 224825-224478 (+) | Exonerate | Cys amb Cys | ||||||
MsrA | MsrA | Equus caballus | SPP00000861 | KK950289.1 | 49419-189674 (-) | Exonerate | Cys amb Cys | |||||
Sel15 | Sel15 | Equus caballus | SPP00000867 | KKK949903.1 | 1961242-1997149 (-) | Genewise | Sec amb Sec | |||||
SelH | SelH | Equus caballus | SPP00000869 | KK951476.1 | 168188-169775 (-) | Genewise | Sec amb Sec | |||||
SelI | SelI | Equus caballus | SPP00000870 | KK950007.1 | 1077742-1100262 (-) | Genewise | Sec amb Sec | |||||
SelK | SelK | Homo sapiens | SPP00000076 | KK951974.1 | 203025-203129 (-) | Genewise | Sec amb Sec | |||||
SelM | SelM | Equus caballus | SPP00000871 | KK953825.1 | 71760-72708 (+) | Exonerate | Sec amb Sec | |||||
SelN | SelN | Equus caballus | SPP00000872 | KK951189.1 | 425542-412120 (-) | Exonerate | Sec amb Sec | |||||
SelO | ||||||||||||
SelO1 | Equus caballus | SPP00000873 | KK951712.1 | 208374-21897 (+) | Exonerate | Sec amb Sec | ||||||
SelO2 | Equus caballus | SPP00000874 | KK952002.1 | 291532-300498 (+) | Exonerate | Cys amb Cys | ||||||
SelO3 | Equus caballus | SPP00000875 | KK950968.1 | 368603-368875 (+) | Exonerate | Cys amb Cys | ||||||
SelP | SelP | Equus caballus | SPP00000876 | KK950737.1 | 575487-581407 (-) | Exonerate | Sec amb Sec? | |||||
SelR | ||||||||||||
SelR1 | Equus caballus | SPP00000877 | KK954428.1 | 46889-49129 (-) | Genewise | Sec amb Sec | ||||||
SelR2 | Equus caballus | SPP00000878 | KK949983.1 | 1183846-1196187 (+) | Exonerate | Cys amb Cys | ||||||
SelR3 | Equus caballus | SPP00000879 | KK949856.1 | 3133307-3240085 (-) | Exonerate | Cys amb Cys | ||||||
SelS | ||||||||||||
SelS | Equus caballus | SPP00000880 | KK951262.1 | ??? (+) | Exonerate Genewise |
Sec amb ? | ||||||
SelS | Homo sapiens | SPP00000100 | KK951262.1 | ??? (+) | Exonerate | Sec amb ? | ||||||
SelT | SelT | Equus caballus | SPP00000881 | KK949882.1 | 563457-568486 (+) | Exonerate | Sec amb Sec | |||||
SelU | ||||||||||||
SelU1 | Equus caballus | SPP00000882 | KK954222.1 | 73547-82587 (+) | Exonerate | Cys amb Cys | ||||||
SelU2 | Equus caballus | SPP00000883 | KK952962.1 | 203909-211517 (-) | Exonerate | Cys amb Cys | ||||||
SelW | ||||||||||||
SelW1 | Homo sapiens | SPP00000124 | ------ | ------ | ------ | Sec amb ? | ||||||
SelW1 | Equus caballus | SPP00000884 | ------ | ------ | ------ | Sec amb ? | ||||||
SelW2 | Homo sapiens | SPP00000127 | KK950318.1 | 84190-85183 (-) | Exonerate | Sec amb ? | ||||||
SelW2 | Equus caballus | SPP00000885 | KK951606.1 | 309544-312652 (-) | Exonerate | Sec amb ? | ||||||
TR | ||||||||||||
TR1 | Equus caballus | SPP00000886 | KK950772.1 | 531244-608813 (-) | Exonerate | Sec amb ? | ||||||
TR2 | Homo sapiens | SPP00000137 | KK953564.1 | 99330-137722 (-) | Exonerate | Cys amb Cys | ||||||
TR3 | Equus caballus | SPP00000888 | KK953348.1 | 120576-163107 (+) | Exonerate | Sec amb Sec |
Família | Subfamília | Espècie | ID | TBLASTN | Scaffold | Exonerate | Genewise | Seqüència | t-coffee | Aliniament | SECIS | SEBLASTIAN |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
eEFsec | eEFsec | Equus caballus | SPP00000889 | KK951551.1 | 188854-359627 (+) | Genewise | ------ | |||||
pstk | pstk | Equus caballus | SPP00000890 | KK951858.1 | 27464-33483 (-) | Exonerate/u> | ------ | |||||
SBP2 | ||||||||||||
SBP2 1 | Equus caballus | SPP00000863 | KK950576.1 | 356332-454832 (-) | Exonerate | ------ | ||||||
SBP2 2 | Equus caballus | SPP00000862 | KK950489.1 | 485273-521292 (+) | Genewise | ------ | ||||||
SECp43 | ||||||||||||
SECp43 1 | Equus caballus | SPP00000891 | KK951401.1 | 245855-247294 (-) | Genewise | ------ | ||||||
SECp43 2 | Equus caballus | SPP00000892 | KK950396.1 | 550977-565834 (-) | Exonerate | ------ | ||||||
SecS | SecS | Equus caballus | SPP00000866 | KK951080.1 | 438703-471382 (-) | Exonerate | ------ | |||||
SPS | ||||||||||||
SPS1 | Equus caballus | SPP00000864 | KK953938.1 | 65958-90168 (-) | Exonerate | Cys amb Cys | ||||||
SPS2 | Equus caballus | SPP00000865 | ------ | ------ | ------ | Sec amb ? |