Després de realitzar un tblastn amb la seqüència de selP es van obtenir diversos resultats per cada protist. Els hits considerats bons són aquells amb un e-value de l'ordre de 10-4; si són superiors a 1 seràn dolents i la resta de valors intermitjos seràn dubtosos. A continuació hi ha els resultats representats en forma de taula:
Organisme | Hit | E-value |
F. cylindrus | Dolent | 5,7 |
P. capsici | Dubtós | 0,41 |
A. laibachii Nc14 | Dolent | 3,0 |
G. niphandrodes | Dubtós | 0,095 |
I. multifiliis strain G5 | Cap | |
S. arctica | Dolent | 6,2 |
P. polycephalum | Dolent | 3,0 |
D. fasciculatum | Dolent | 2,9 |
D. discoideum AX4 | Dolent | 7,1 |
L. donovani BPK282A1 | Dolent | 2,3 |
L. tarentolae | Dubtós | 0,73 |
T. congolense | Dubtós | 0,56 |
C. fasciculata | Dolent | 3,4 |
A. rara | Dolent | 3,1 |
Taula 1. Els valors dels hits obtinguts en el procés d'automatització del blast es troben recopilats en aquest arxiu.
Seqüència protèica del S. kowalevskii
Es va realitzar un tblastn mitjançant automatització contra el genoma del protista Saccoglossus kowalevskii el qual se sap que comparteix el primer domini N terminal de la selenoproteïna P humana com es veu en el següent hipervincle del Tcoffee de les dues seqüències.
Taula2. Els valors dels hits obtinguts realitzant un tblastn de forma automàtica els podeu veure en el següent arxiu.
- El Tcoffee obtingut no s'alinea la U amb una altra U o una C, a més la proteïna de genewise resultant de A. laibachi Nc14 consta de molt pocs aminoàcids.