Resultados

A continuación mostramos una tabla resumen con los resultados obtenidos en nuestra búsqueda.

Hemos realizado un tBLASTn usando como query la familia de GPX humanas, ya que, aunque sea lejano filogenéticamente respecto de los protistas, es el único organismo que presenta todas las proteínas de la familia estudiada.

En humanos, se han secuenciado 8 GPX, de las cuales, la GPX5, GPX7, GPX8 son homólogos en cisteína. Aún y así, las hemos tenido en cuenta para nuestro estudio. Todas estas proteínas, al pertenecer a una misma familia, son muy parecidas entre ellas y por lo tanto hemos de ser conscientes de que muchos de los resultados que obtendremos serán prácticamente idénticos.

Familia GPx
Protistas	GPx1			GPx2			GPx3			GPx4
	Hits	Hits significativos	Homólogo en cisteína	Hits	Hits significativos	Homólogo en cisteína	Hits	Hits significativos	Homólogo en cisteína	Hits	Hits significativos	Homólogo en cisteína
Thalassiosira pseudonana	6	0	-	5	1	No	4	1	No	8	1	No
Phytophthora sojae	12	3	Sí	6	5	Sí	6	4	Sí	9	3	Sí
Phytophthora ramorum	6	1	Sí	6	1	Sí	7	1	Sí	7	1	Sí
Theileria annulata	2	0	-	4	0	-	2	0	-	2	0	-
Theileria parva	1	0	No	5	0	No	3	0	No	2	0	No
Babesia bovis	2	0	-	1	0	-	1	0	-	3	0	-
Entamoeba Histolytica	1	0	-	0	0	-	2	0	-	2	0	-
Entamoeba terrapinae	0	0	-	7	0	-	1	0	-	3	0	-
Trypanosoma cruzi	8	4	Sí	5	4	Sí	7	4	Sí	9	5	Sí
Monosiga brevicollis	6	0	-	3	0	-	5	0	-	10	1	Sí
Giardia intestinalis	3	0	No	1	0	No	4	0	No	3	0	No

Familia GPx
Protistas	GPx5			GPx6			GPx7			GPx8
	Hits	Hits significativos	Homólogo en cisteína	Hits	Hits significativos	Homólogo en cisteína	Hits	Hits significativos	Homólogo en cisteína	Hits	Hits significativos	Homólogo en cisteína
Thalassiosira pseudonana	2	1	No	4	1	No	2	1	No	2	2	No
Phytophthora sojae	8	4	Sí	5	4	Sí	16	5	Sí	6	3	Sí
Phytophthora ramorum	6	1	Sí	8	1	Sí	4	2	Sí	4	2	Sí
Theileria annulata	2	0	-	2	0	-	2	0	-	2	0	-
Theileria parva	2	0	No	2	0	No	0	0	-	2	0	-
Babesia bovis	1	0	-	4	0	-	5	0	-	1	0	-
Entamoeba Histolytica	6	0	-	2	0	-	1	0	-	5	0	-
Entamoeba terrapinae	1	0	-	0	0	-	4	0	-	2	0	-
Trypanosoma cruzi	6	5	Sí	10	5	Sí	8	5	Sí	5	5	Sí
Monosiga brevicollis	3	0	-	2	0	-	8	1	No	4	0	-
Giardia intestinalis	2	0	-	6	0	No	7	0	-	3	0	-

En la tabla presentamos el número de hits obtenidos, y cuántos de ellos son significativos. Estos han sido obtenidos a partir del análisis de los diferentes tBLASTn que se presentarán en la tabla individual de cada uno de los protistas.

Consideraremos un hit significativo cuando este tenga un E-value menor de 0 y haya un alineamiento entre la selenocisteína humana y una cisteína o un codón stop en el genoma estudiado. Para comprobar que se trata de una proteína, nos cercioraremos de que este alineamiento se encuentra en una región exónica.

En algunos de los protistas estudiados nos aparecen una gran cantidad de hits significativos, los cuales hemos analizado individualmente. Podemos ver que, utilizando diferentes querys, muchas veces encontramos el mismo gen.