Resultados
En la tabla siguiente se pueden observar los resultados del análisis del genoma de Monosiga brevicollis.
Monosiga brevicollis |
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Hits | E-value | GFF | cDNA | Proteína | T coffee | Secis | ||
GPX1 | TBlastN | 0 Hit | ||||||
GPX2 | TBlastN | 0 Hit | ||||||
GPX3 | TBlastN | 0 Hit | ||||||
GPX4 | TBlastN | Hit 1 | 4e-05 | |||||
GPX5 | TBlastN | 0 Hit | ||||||
GPX6 | TBlastN | 0 Hit | ||||||
GPX7 | TBlastN | Hit 1 | 8e-06 | |||||
GPX8 | TBlastN | 0 Hit |
Discusión
En esta tabla mostramos los resultados obtenidos al analizar mediante tBLASTn el genoma de Monosiga Brevicollis. Como podemos observar, solamente encontramos dos homólogos de selenoproteínas humanas. Todas las secuencias son muy parecidas entre ellas pero, como se puede ver, los dos hits encontrados se parecen al GPX4 y GPX7 humanos. La secuencia del hit más parecido al GPX7 humano es un poco más larga que la del hit parecido al GPX4, por lo tanto, o bien se ha conservado más fragmento del mismo, o bien hemos podido coger un fragmento más largo que en el caso de GPX4. Aun así, tanto en el caso del primer hit como en el caso del segundo, la secuencia homóloga conseguida es pequeña, lo que nos hace pensar que sólo se ha conservado el núcleo de la secuencia de la selenoproteína. Ambas proteínas son homólogos en Cys.