ABSTRACT
Las selenoproteínas son péptidos en los cuales encontramos residuos de Sec (conocido también como el aminoácido 21), que son codificados por el codón UGA, que también puede codificar para un STOP. Es necesario que las selenoproteínas presenten un elemento SECIS en el extremo 3'UTR, de forma que durante su síntesis, se incorporen Secs en lugar de codones STOP. Esta dualidad hace difícil la caracterización de selenoproteínas en diferentes especies, por lo que son necesarias herramientas computacionales.El objetivo de este trabajo es identificar el selenoproteoma de Macaca nemestrina o mono de cola de cerdo. Para ello, se ha llevado a cabo un análisis in silico por homología con el selenoproteoma anotado de Homo sapiens, que es el mejor conocido hasta el momento. Ha sido necesaria la obtención del genoma de Macaca nemestrina indexado, así como de un programa capaz de automatizar el proceso de análisis en la medida de lo posible, a través de diversos pasos: tBlastn, Exonerate, T-Coffee y Genewise. Se ha llevado a cabo también una búsqueda de los elementos SECIS para confirmar la presencia de selenoproteínas mediante el programa SECISearch3/Seblastian. Se han conseguido detectar 23 selenoproteínas, 10 homólogos de cisteína u otros homólogos, y 7 proteínas de maquinaria traduccional. Remarcaremos que estos elementos han sido hallados, como hemos dicho, por homología con el selenoproteoma anotado en Homo sapiens, y que serían necesarios nuevos estudios experimentales para completar el selenoproteoma tanto de Macaca nemestrina como de todas las demás especies en las diferentes bases de datos.  |
