SelenoproteinsThioredoxinReductase
Recerca en genomes de protistes
T. cruzi
Query | A. anophagefferens TR1 humà |
BLAST | A. anophagefferens TR1 humà |
Els alineaments que resulten del tBLASTn de TR de A.anophagefferens i humà (queries) i el genoma d'aquest protista són molt significatius, tal i com podem veure al fitxer adjunt.
El hit analitzat és el corresponent al scaffold gi|70868647|gb|AAHK01002040.1|, que presenta un E-value de 2e-53. Tanmateix, al resultat reportat pel tBLASTn, en aquest alineament no hi constava ni una selenocisteïna ni tampoc una cisteïna, ja que faltava un fragment final que no s'alineava.
Un cop teníem la nostra proteïna potencial extreta, vàrem realitzar un BLASTp en una base de dades no redundant (nr database; NCBI). El resultat obtingut indicava que no es tractava d'una proteïna de la família de les Thioredoxin reductases.
Tornar enrera