Selenoproteïna I (SelI)
SelI és una selenoproteïna de la qual no es coneix la seva funció.
Resultats
TblastN
El TblastN obtingut de llençar la SelI humana contra el genoma de P. marinus ha donat el següent resultat:
Clica la imatge per veure-la gran
Hem seleccionat el contig gi|126302066|gb|AAXJ01000439.1| per seguir amb l'estudi de SelI ja que és el que té un millor e-value, 1 e-11. Per veure l'alineament prem aquí.
Predicció de la SelI en P. marinus
La predicció exònica l'hem realitzat amb el programa Exonerate, i no ha donat cap resultat.
La predicció peptídica i ded cDNA l'hem realitzat amb el programa Genewise, i ha donat les següents prediccions: aquí.
Clica la imatge per veure-la gran
Clica la imatge per veure-la gran
Alineament de la SelI predit
T-coffee Amb el programa T-coffee hem alineat la proteïna predita amb la proteïna de partida, en aquest cas la SelI humana:
Blastcl3 nr El resultat del blastcl3 per la SelI predita no mostra cap alineament de la SelI amb la mateixa proteïna d’altres organismes. Per veure el resultat clica aquí.
Pfam
La cerca de dominis en la SelI humana i en la predita dóna els següents resultats: