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El objetivo de nuestro projecto consiste en anotar genes de selenoproteínas en el genoma de Pan troglodytes a partir de la secuencia aminoacídica de las selenoproteínas de Homo sapiens.
Hemos elegido el genoma de Pan troglodytes porque es un genoma recientemente secuenciado y del cual todavía no se han anotado los genes codificantes para las selenoproteínas. Además, las diferencias entre los genomas de Homo sapiens y Pan troglodytes son sólo de un 1%, con lo que esperamos encontrar una alta conservación. Por tanto esperamos encontrar un alto número de las selenoproteínas anotadas en el genoma humano.
Para reducir la región del genoma de chimpancé en la que esperamos encontrar regiones codificantes para las selenoproteínas de chimpancé hacemos una primera aproximación mediante el tBLASTn . A continuación hacemos una predicción de la estructura exónica mediante el exonerate. Finalmente anotaremos las selenoproteínas en el genoma de Pan troglodytes.