Se ha descrito que los genomas de los Herpesvirus tipo 1 y 4 tienen 76 orfs que codifican para 77 genes debido a fenómenos de splicing². Aún así mientras nuestra búsqueda ha identificado todos los orfs para EHV-4, en la secuencia de EHV-1 tan solo hemos encontrado 75 orf que corresponden a 76 genes (ya que el orf que sufre splicing sí ha sido identificado). No hemos podido identificar el orf 51. Además, también hay algunas diferencias entre el número de nucleótidos, no solamente por lo que refiere a nuestras predicciones sinó también entre Telford et al. y la entrada de Medline. De hecho, las principales diferencias aparecen cuando comparamos nuestras predicciones y Medline con Telford.

A parte de los orfs descritos, hemos identificado otros 6 orfs potencialmente codificantes para proteína en el genoma de EHV-1, 5 de ellos (ver tabla 4) usando Blast y alineándolos con Clustalw, de modo que presentan identidad con otros genomas de Herpesvirus; y 1 que contiene un dominio conservado (ver resultados). Este último no muestra identidades significativas mediante Blast con otros genomas. Para el genoma de EHV-4 hemos identificado un nuevo orf potencialmente codificante para proteína (ver tabla 4).

A partir de ahora, la tarea que deberķa llevarse a cabo sería la búsqueda biológica de estos orfs, ya que si encontramos su ADNc en el virus podremos confirmar nuestra predicción. Además, podríamos repetir la búsqueda de orfs inclyendo aquellos con un número de aminoácidos entre 60 y 100, así como los orfs que no empiezan por Met.