Резюме

Селен - микроэлемент необходимый для жизни многих организмов. Он не может быть найден в виде простого вещества из-за высокой токсичности и, таким образом, он находится в природе в основном в виде остатка селеноцистеина (Sec) в селенобелках. Селеноцистеин – 21 аминокислота и она кодируется кодоном TGA, также функционирующим, как и СТОП-кодон. Из-за этой двойственности, предсказание селенобелков в геномах является сложной задачей и, обычно, селеноцистеины определяются неправильно.

Цель этой работы – узнать локализацию генов, кодирующих селенобелки в геноме Balaenoptera acutorostrata, также известном как малый полосатик. С этой целью были разработаны биоинформатические программы. Это осуществляется с использованием различных средств, таких как BLAST, Exonerate и T-Coffee. Для выравнивания интересующего нас генома используются модельные геномы дельфина (Tursiops truncates), человека (Homo sapiens) и лошади (Equus caballus).

В общей сложности были охарактеризованы 25 селенобелков, 7 Cys-гомологов и 7 белковых машин (одна из которых включена в селенобелковую группу). Полученные результаты находятся в соответствии с селенопротеомом позвоночных и его эволюцией.

Подводя итог, это исследование представляет шаг вперед в области описания селенобелков млекопитающих, потому что оно дает знания о неописанных ранее видах.