Discussió

MAQUINÀRIA

eEFSec1

A la taula es pot observar a quin scaffold es troba la proteïna, en quin sentit respecte l'anotació es transcriu i les coordenades de la proteïna predita per l'exonerate.

En aquest cas, vam obtenir només un hit amb el BLAST: la proteïna eEFSec es troba a l'scaffold GL841600.1 i està codificada en el mateix sentit que l'anotació (forward).

Hem obtingut la predicció només mitjançant el programa exonerate:

  • La predicció d'exonerate té 223952 nucleòtids, que inclouen sis exons i cinc introns, i una raw score de 1971.

Aquesta predicció inclou la major part de la proteïna query, excepte l'inci de la mateixa.

Tenint en compte que no es tracta d'una selenoproteïna, no s'ha trobat cap selenocisteïna ni element secis, tal com s'esperaria.

Selenoprofiles

El Selenoprofiles només troba un hit per aquesta proteïna i a més, aquest hit ens coincideix amb la posició de la proteïna trobada per nosaltres.