Resultats de SelI
I. multifiliis
El tBLASTn reporta 7 hits significatius en contigs diferents, tanmateix, només hem analitzat els dos primers hits ja que són els que tenen un millor E-value i, a més, els alineaments que s'obtenen amb la resta de hits són molt curts en comparació amb els dos hits que finalment hem analitzat. El primer hit en el contig gi|340500832|gb|GL984333.1| dóna un E-value de 2x10-23 i alinea des del residu 40 al 430, així que tot i que alinea una regió extensa de la proteïna no arriba a incloure en l'alineament la selenocisteïna. El segon hit, en el contig gi|340508397|gb|GL983202.1| té un E-value de 9x10-11 i alinea des del residu 113 al 233, de manera que tampoc alinea la selenocisteïna.
Exonerate prediu, per al hit en el contig gi|340500832|gb|GL984333.1| un únic exó i alinea des del residu 40 al 172. En canvi, per al hit en el contig gi|340508397|gb|GL983202.1| no s'obté cap resultat. Per aquest motiu, analitzem el resultat obtingut per a aquest contig amb el programa Genewise. Amb aquest obtenim dos alineaments, des del residu 183 al 192 i un altre des del residu 180 al 198. Tanmateix, com que els dos resultats obtinguts amb els programes de predicció de gens no són gaire bons, descartem el hit obtingut en el contig gi|340508397|gb|GL983202.1|.
L'alineament amb Tcoffee del hit en el contig gi|340500832|gb|GL984333.1| dóna un score de 90 però només alinea la regió N-terminal de la proteïna i el grau de conservació no és perfecte.
El BLASTp contra la base de dades de l'NCBI utilitzant com a query la proteïna predita ens reporta hits corresponents a CDP-alcohol fosfatidiltransferases, entre elles de A.laibachii o de P.infestans. A més, també obtenim com a hit una proteïna sense funció anotada de I.multifiliis amb un E-value de 10-82. Així doncs, la proteïna predita presenta certa homologia amb una CDP-alcohol fosfatidiltransferasa però en cap cas es tracta d'una selenoproteïna.