Resultats de MSP
D. fasciculatum
Els tBLASTn amb la query MSP de D.discoideum_AX4 reporta un hit significatiu en el contig gb|GL883021.1| amb un E-value de 9x10-61. El hit obtingut s'alinea amb la totalitat de la proteïna i, a més, les dues selenocisteïnes de la query estan alineades amb stop codons.
Exonerate prediu un gen amb dos introns i ens alinea des de l'aminoàcid 24 al 227, és a dir, no ens alinea la primera selenocisteïna però si la segona amb un codó STOP (TGA). El programa no ens prediu cap intró. Pel que fa al resultat de Genewise, ens alinea des de l'aminoàcid 24 al 220 i tampoc ens prediu cap intró. Així doncs, amb cap dels dos programes aconseguim alinear la primera selenocisteïna. Per aquest motiu, i tenint en compte el resultat del tBLASTn, decidim ampliar la predicció de l'exó de Exonerate per l'extrem 5' de forma manual.
Amb aquesta modificació aconseguim alinear amb Tcoffee les dues selenocisteïnes amb codons STOP i amb un score de 94.