Identificación de selenoproteínas en protistas
Brugada V, Frías S, Fuentes P, García C.
Maquinaria
Con el objetivo de confirmar la presencia o ausencia de selenoproteínas en los distintos protistas, buscamos los elementos de la maquinaria necesarios para la síntesis de éstas.
En la siguiente tabla, se muestran los resultados obtenidos con el programa T-Coffee. Estos datos han sido seleccionados a partir de los E-values significativos que se han obtenido al realizar un tBLASTn con distintas queries de los elementos de la maquinaria presentes en otras especies. Además, hemos realizado la búsqueda del tRNAsec en el genoma de los protistas. Concretamente, hemos analizado los siguientes elementos de la maquinaria: eEFsec, PSTK, SBP2, Sec43p, SLA/LP y SPS2.
| Organismo | eEFsec | PSTK | SBP2 | Sec43p | SLA/LP | SPS2 | tRNA |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| A. rara |  |
|
|
|
|
|
NO |
| C. fasciculata |  |
|
|
|
|
|
NO |
| T. congolense | |
|
|
|
|
|
NO |
| L. tarentolae | |
|
|
|
|
|
NO |
| L. donovani | |
|
|
|
|
|
NO |
| D. discoideum | |
|
|
|
|
|
NO |
| D. fasciculatum | |
|
|
|
|
|
NO |
| P. polycephalum | |
|
|
|
|
|
NO |
| S. arctica | |
|
|
|
|
|
NO |
| I. multifiliis | |
|
|
|
|
|
NO |
| G. niphandrodes | |
|
|
|
|
|
SÍ |
| A. laibaichii | |
|
|
|
|
|
SÍ |
| P. capsici | |
|
|
|
|
|
NO |
| F. cylindrus | |
|
|
|
|
|
SÍ |