Después de analizar los genomas de los protistas seleccionados se puede ver que las familias SelT, SelV y SelW no están presentes en la mayoría de éstos. Únicamente se encontraron selenoproteínas en los genomas de: M. brevicollis (SelW1), T. cruzi (SelT), T. pseudonana (SelT).

También se han encontrado homólogos con cisteína en: G. intestinalis (SelW2) y P. sojae (SelT).

De nuestra investigación cabe destacar que la familia SelV se encuentra exclusivamente en vertebrados. Por esta razón no se ha encontrado ningún homólogo en los genomas de protistas.

En cuanto a la familia SelW se han hallado dos sub-familias: SelW1 y SelW2.

Finalmente, tras la búsqueda de elementos SECIS en las secuencias 3' UTR de las selenoproteínas halladas, se han encontrado dichos elementos para: SelW1 de M. brevicollis y SelT de T. pseudonana.

Tras semanas de trabajo y familiarización con los recursos proporcionados, se ha podido concluir que un mejor ensamblaje y orden de los genomas de partida (en lugar de la división por contigs) facilitaría mucho la tarea de búsqueda de cualquier proteína.

Además, se podrían usar queries más cercanas filogenéticamente para encontrar alineamientos más precisos.