Selenocisteïna sintasa (SecS o SLAP/LP)

És l'encarregada de dur a terme la síntesí de l'aminoàcid, en la transformació de la serina a selenocisteïna. A més a més, sembla estar implicada també en la introducció de l'aminoàcid en la cadena durant la traducció actuant de manera conjunta amb secp43.

Com en casos anteriors, la presencia d'aquest enzim és indispensable per aconseguir la produció de la selenoproteïna. Vam iniciar la cerca d'aquesta de la mateixa manera que vam iniciar les altres, és a dir, buscant a la base de dades la proteïna, en aquest cas, es va fer servir l'ortòloga murina.

A constinuació es va procedir amb un tblastn d'aquesta proteïna amb el genoma del Plasmodium. Hi va haver un únic resultat, un hit amb un E-value de 4-e65. Es va procedir a extreure el contig en el qual es trobava la regió identificada com a contenidora de la regió d'interès i, a continuació, es va procedir amb un Exonerate, el resultat del qual va ser bastant favorable.

A partir del resultat de l'Exonerate vam obtenir el cDNA i la seqüència proteica.


Descarregar l'anotació del gen en format GFF.

Descarregar el cDNA del gen.

Descarregar la seqüència de la proteïna.


Aquí podeu descarregar tota la documentació referent a SecS.