Resultados

El objetivo del programa utilizado, cluster_genomic2_allPerl.pl, es mapear el genoma de Drosophila melanogaster en ventanas de 7 genes, con el fin de encontrar clusters de genes (mínimo 3 genes para que se considere cluster), teniendo en cuenta que su probabilidad sea mayor que la esperada por azar.

Con estos criterios, el resultado obtenido está representado en las tablas siguientes. Cada tabla representa los genes que forman el cluster, el cromosoma en el que se encuentran, el inicio y final de la región que engloba al cluster y el p-value. Además los clusters encontrados están clasificados según la función en la que están implicados los genes (término GO).

GO:0006858 = transporte extracelular
Cromosoma	Genes	Inicio	Final	p-value
2L	CG7075, CG13795, CG13796	7474893	7810697	0,0002
2R	CG15088, CG15094, CG15096	14232991	14365542	0,0004
2R	CG30272, CG30265, CG12490	18268186	18444530	9,47 x e-06
3R	CG14855, CG14856, CG14857	10483192	10725966	0,0009
3R	CG6006, CG8925, CG6126	11906720	12149184	0,0009
3R	CG17751, CG7333, CG7342, CG17752, CG16727, CG6231	15235044	15497182	4,084 x e-09
3R	CG8932, CG31090, CG8934, CG8957, CG8966	21721601	22016924	4,416 x e-07
3R	CG2196, CG2187, CG2191	27505602	27806125	0,0009

GO:0004252 = regulación de la progresión del ciclo celular
Cromosoma	Genes	Inicio	Final	p-value
2R	CG8181, CG8213, CG11824, CG8172, CG13744, CG8170	4439986	4610280	1,92 x e-10
3L	CG32271, CG33159, CG32277, CG33160	3152906	3274825	6,02 x -06
3L	CG6462, CG10477, CG6592, CG10472, CG10469	5895245	6113920	6,02 x e-06
3L	CG16998, CG32374, CG32376	7445556	7687597	0,0003
3R	CG17404, CG12256, CG3916, CG10041	8020733	8234475	1,3 x e-05
3R	CG17475, CG31265, CG4053, CG31267, CG5246, CG5255	12898408	12985670	1,39 x e-09
3R	CG11841, CG11842, CG11843	24852896	24972523	0,0005

GO:0005386 = transportador tipo carrier
Cromosoma	Genes	Inicio	Final	p-value
2R	CG8323, CG18327, CG18324	9522197	9719519	0,0001
2R	CG17664, CG17662, CG4019	19071678	19221520	0,0001
3L	CG8629, CG15829, CG8628	7060515	7334509	0,0001

GO:0008202 = metabolismo de esteroides
Cromosoma	Genes	Inicio	Final	p-value
2L	CG13284, CG31810, CG31809, CG6012	16787700	16906360	3,52 x e-07
3R	CG10170, CG16732, CG10168	19238329	19511991	3,65 x e-06

GO:0009636 = respuesta a toxinas
Cromosoma	Genes	Inicio	Final	p-value
3L	CG6776, CG6781, CG6673, CG6662	8412633	8608028	1,31 x e-07
3R	CG10170, CG16732, CG10168	19238329	19511991	8,30 x e-05

GO:0005198 = actividad estructural
Cromosoma	Genes	Inicio	Final	p-value
2R	CG17739, CG30203, CG30046	7773188	7907561	5,96 x e-06

GO:0005976 = metabolismo de polisacáridos
Cromosoma	Genes	Inicio	Final	p-value
3R	CG10170, CG16732, CG10168	19238329	19511991	1,71 x e-05

GO:0006520 = metabolismo de aminoácidos
Cromosoma	Genes	Inicio	Final	p-value
2L	CG7075, CG13795, CG13796	7474893	7810697	4,17 x e-05

GO:0006915 = apoptosis
Cromosoma	Genes	Inicio	Final	p-value
2L	CG7228, CG7227, CG7221	7885425	8043714	5,72 x e-05

GO:0007166 = receptor de superficie unido a señal de transducción
Cromosoma	Genes	Inicio	Final	p-value
3R	CG7800, CG18249, Arf84F	3948420	4188601	1,71 x e-05

GO:0007275 = desarrollo
Cromosoma	Genes	Inicio	Final	p-value
2L	CG13101, CG17906, alien	8684350	9385084	0,0002

GO:0007422 = desarrollo del sistema nervioso periférico
Cromosoma	Genes	Inicio	Final	p-value
X	ac, ase, Appl	147163	732552	7,01 x e-07

GO:0008017 = unión a microtúbulos
Cromosoma	Genes	Inicio	Final	p-value
X	CG32820, CG17450, CG32819	21111038	21836108	1,38 x e-05

GO:0016337 = adhesión célula-célula
Cromosoma	Genes	Inicio	Final	p-value
X	CG32750, CG32751, CG3599	5834047	6124507	1,38 x e-05

Visualización de los clusters según su localización en el cromosoma:

Cromosoma 2L

Cromosoma 2R

Cromosoma 3L

Cromosoma 3R

Cromosoma X