INTRODUCCIÓ
En el complex món dels ecosistemes, trobem relacions entre els diferents membres que el componen, com per exemple: simbiosi, parasitisme, comensalisme, etc. En el cas d'algunes espècies del regne vegetal trobem relacions del tipus simbiòtiques entre la planta i algunes espècies de bacteris del gènere Agrobacterium. Per tal de resoldre el repte que se'ns planteja en aquest projecte, ens basarem en l'estudi dels plàsmids d'Agrobacterium rhizogenes i tumefaciens.
Dins del T-DNA del plàsmid A. rhizogenes es localitza, entre d'altres gens, l'ORF, la funció del qual és desconeguda.
A partir de la seqüència codificadora del gen ORF 8 del nostre i d’altres plàsmids, i la regió upstream que conté el seu promotor, l'objectiu d'aquest projecte serà intentar esbrinar la seva funció fent servir totes les eines de cerca d'homologies al nostre abast i la seva aplicació sobre les bases de dades de seqüències i de dominis protèics.
A.rhizogenes:
El seu material genètic està distribuit en un cromosoma principal que conté, entre d’altres, gens implicats en la infecció (Chv), i un plàsmid. Aquest plàsmid s'anomena Ri i està format per la regió vir i el T-DNA.
La regió vir és la responsable de la transferència del T-DNA a la cèl·lula vegetal, mentre que el T-DNA és alló que es transfereix.
Aquest T-DNA està dividit en dos segments: dret i esquerre (R i L) que codifiquen per a diferents gens. El segment R conté els gens responsables de la biosíntesi d'opines i d’auxines, mentre que el segment L conté els gens rol responsables de la formació d'arrels transformades.
A.tumefaciens :
El seu material genètic està distribuit en el cromosoma principal i un plàsmid. El cromosoma conté els gens responsables del procés d’infecció (Chv) i altres implicats en la biosíntesis de citoquinines. El plàsmid s'anomena Ti i està format per la regió vir i el T-DNA.
La regió vir és la responsable de la transferència del T-DNA a la cèl·lula vegetal, mentre que el T-DNA és allò que es transfereix. Aquest T-DNA està flanquejat per l'extrem dret (BD) i l'extrem esquerra (BI). Només el DNA contingut entre aquests extrems és transferit a les plantes i provoca el desenvolupament de tumors degut a que els gens que conté codifiquen per a fitohormones (auxines i citoquinines) i per a proteïnes per a la síntesi d'opines.
