SPS1 pertany a la família de les Selenophosphate synthase (SPS) encarregades de la formació de selenoproteïnes. Tot i que la seva funció exacte no es coneix, sembla ser que participa en el procés de reciclatge de la selenocisteïna. S'ha vist que no només es troba en aquells organismes que tenen selenoproteïnes, el que fa pensar que té altres funcions importants. En humans, SPS1 no conté selenocisteïna, sinó que té treonina.

TblastN

En el TblastN s'obté un alineament amb un e-value molt baix en el contig gi|126302146|gb|AAXJ01000359.1| en que la treonina humana s'alinea amb un codó stop.

Per veure el fitxer de l'alineament clica aquí.

Aquest mateix fragment del nostre genoma també s'alinea amb SPS2, que en lloc de tenir treonina té selenocisteïna. D'aquesta manera es dedueix que el hit corresponent a SPS1 en realitat es tracta de SPS2.

SPS1 no existeix en Perkinsus marinus, fet que crida l'atenció ja que aquesta proteïna té altres funcions a part de participar en el metabolisme del seleni.

torna a resultats       ↑