Selenoproteïna P (SelP)

La SelP és una glicoproteïna extracel·lular d’unió a heparina, que sembla estar associada a cèl·lules endotelials, amb funcions antioxidants a l'espai extracel·lular.

Resultats


TblastN

El TblastN obtingut de llençar la SelP humana i de Pan troglodytes contra el genoma P. marinus ha donat el següent resultat:

Clica la imatge per veure-la gran

Tot i que els millor hits en el blast tenen uns e-value de 2 e-5 i 9 e-6, per la humana i la de ximpanzé respectivament, però els alineaments no són bons, no prosseguim en el seu anàlisi. Per veure l’alineament premeu aquí.

Discussió

El millor hit del TblastN té un e-value de 2 e-5, per la SelP humana, i de 9 e-6 per la de ximpanzé. Els alineaments no són bons, ja que es corresponen a una regió de baixa complexitat, per tant les similituds que es poguessin donar entre la SelP i el genoma P. marinus es poden donar per atzar.

torna a resultats      

 

Universitat Pompeu Fabra