Selenoproteïna M (SelM)

La SelM és una selenoproteïna caracteritzada en humà i ratolí. S'expressa en una gran varietat de teixits, amb nivells incrementats en el cervell.

Resultats


TblastN

El TblastN obtingut de llençar la SelM de humana i murina contra el genoma de P. marinus ha donat el següent resultat:

Clica la imatge per veure-la gran

El millor hit en el blast té un e-value de 0.14 per la SelM humana, i 1.7 per la murina. La predicció de la SelM murina, al tenir un e-value de 1.7 la descartem, i com que l'alineament de la SelM humana tampoc és bo també la descartem. Per tant no prosseguim en el seu anàlisis. Per veure l’alineament premeu aquí.

Discussió

Com que el millor hit del TblastN té un e-value de 0.14, per la SelM humana, i l'alineament tampoc és bo, les similituds que es poguessin donar entre la SelM i el genoma P. marinus es poden donar per atzar.

torna a resultats      

 

Universitat Pompeu Fabra