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2. BLAST vía web para encontrar homologías.
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OBJETIVO:
Hacer un primer screening de todos los plásmidos bacterianos que presenten homología con el plásmido
pRi2659 y, concretamente, con el gen ORF13.
PASOS:
- Bajar de NCBI la secuencia del fragmento T-DNA
del plásmido pRi2659
e identificar la posición de ORF-13.
- Recopilar todas las secuencias de bacterias que presenten
homología con el T-DNA del plásmido pRi2659 y concretamente con ORF-13.
- Realizar un BLAST con el plásmido pTi15955
de A.tumefaciens (al cual se hace referencia en el proyecto de trabajo).
- Realizar un BLASTn (del T-DNA del plásmido pRi2659 contra genomas eucariotas) para comprobar la existencia de secuencias
homólogas en plantas.
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