T-COFFEE, Version_11.00.8cbe486 (2014-08-12 22:05:29 - Revision 8cbe486 - Build 477)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=967
*
 BAD AVG GOOD
*
SPP00000125_2.0   :  95
KQ028730.1_subs   :  97
cons              :  96

SPP00000125_2.0   MALAVRVVYCGAXGYKSKYLQLKKKLEDEFPGR
KQ028730.1_subs   --LMIQAIYHGAQDXKSMYFQPKKKLENKFPRC

cons                * ::.:* ** . ** *:* *****::**  


SPP00000125_2.0   LDICGEGTPQATGFFEVMVAGKLIHSKKKGDGY
KQ028730.1_subs   PDICGKRTPQATGFFEVMVVFMVIASLEKGQWL

cons               ****: ************.  :* * :**:  


SPP00000125_2.0   VDTESKFLKLVAAIKAALAQG
KQ028730.1_subs   HGQGEQVSEAGGCYQS-----

cons               .  .:. :  .. ::