T-COFFEE, Version_9.03.r1318 (2012-07-12 19:05:45 - Revision 1318 - Build 366)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=94
*
 BAD AVG GOOD
*
Homo          :  94
Pan           :  94
Macaca        :  94
Pongo         :  94
Chlorocebus   :  91
cons          :  94

Homo              1 AAATGCCAGGGGGCTCGGACATGGGTGCCCACAGGGTAG   39 
Pan               1 AAATGCCAGGGGGCTCGGACATGGGTGCCCACAGGGTAG   39 
Macaca            1 AAATGCCAGGGGGCTCGGACATGTGTGCCCACAGGGTGG   39 
Pongo             1 AAATGCCAGGGGGCTCGGACATGGGTGCCCACAGGGTAG   39 
Chlorocebus       1 TGCTGCCAGATAATGACGACCTGGGTGGAAACCCACCCT   39 

cons              1    ******        *** ** ***   **          39 


Homo             40 GTTTCCACCCAGGTCGTCATCATCTGGCACCA   71 
Pan              40 GTTTCCACCCAGGTCGTCATCATCTGGCACCA   71 
Macaca           40 GTTTCCACCCAGGTCGTCATCATCTGGCAGCA   71 
Pongo            40 GTTTCCACCCAGGTCGTCATCATCTGGCACCA   71 
Chlorocebus      40 GTGGGCACCCATGTCCGAGCCCCCTGGCATTT   71 

cons             40 **   ****** ***     *  ******      71