T-COFFEE, Version_10.00.r1580 (2013-10-01 16:11:20 - Revision 1580 - Build 429)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=99
*
 BAD AVG GOOD
*
Homo          :  99
Pan           :  99
Pongo         :  99
Macaque       :  99
Chlorocebus   :  99
cons          :  99

Homo              1 MNNQARTPAPSSARTSTSVRASTPTRTPTPLRTPTPVRTRTPIRTLTPVLTPSPAGTSPLVLTPAPAQI   69 
Pan               1 MNNQARTPAPSSARTSTSVRASTPTRTPTPLRTPTPVRTRTPIRTLTPVLTPSPAGTPPLVLTPAPAQI   69 
Pongo             1 MNNQARTPAPSSARTSTSVRASTPTRTPTPLRTPTPVRTRTPIRTLTPVLTPSPAGTPPLVLTPAPAQI   69 
Macaque           1 MNNQARTPAPSSARTSTSVRASTPTRTPTPLRTPTPVRTRTPIRTQTPVLTPSPARLPALVQPPAPAHI   69 
Chlorocebus       1 MNNQARTPAPSSARTSTSVRASTPTRTPTPLRTPTPVRTRTPIRTQTPVLTPSPARLPALVQPPAPAHI   69 

cons              1 ********************************************* *********  ..** .****:*   69 


Homo             70 PTLVPTPALARIPRLVPPPAPAWIPTPVPTPVPVRNPTPVPTPARTLTPPVRVPAPA----PAQLLAGI  134 
Pan              70 PTLVPTPALARIPRLVPPPAPAWIPTPVPTPVPVRNPTPVPTPARTLTPPVRVPAPA----PAQLLAGI  134 
Pongo            70 PTLVPTPALARIPRLVPPPAPAWIPTPVPTPVPVRNPTPVPTPARTLTTPVRVPAPA----PAPPPAQV  134 
Macaque          70 PTQVPTPALARIPGLVPPPARAWIPTPVPTPARVRNPTPVPTPARTLTPPVRVPAPAP--DPAQVLAGI  136 
Chlorocebus      70 PTQVPTPALARIPGLVPPPARAWIPTPVPTPARVRNPTPVRTPARTLTPPVRVPAPAPAPDPAQVLAGI  138 

cons             70 ** ********** ****** **********. ******* *******.********    **   * :  138 


Homo            135 RAALPVLDSYLAPALPLDPPPEPAPELPLLPEEDPEPAPSLKLIPSVSSEAGPAPGPLPTRTPLAANSP  203 
Pan             135 RAALPVLDSYLAPALPLDPPPEPAPELPLLPEEDPEPAPSLKLIPSVSSEAGPAPGPLPTRTPLAANSP  203 
Pongo           135 RAALPILDSYLAPALRLHPPPEPAPELPLSPEEDPEPAPSLKLIPSVSSEAGPAPGPLPARTPQAANSP  203 
Macaque         137 RTALPALDSYPAPALSLDSPPEPAQEPPLSPEEDPEPAPSLKLIPSVSSEAGPALGPLPAHTPLAAK--  203 
Chlorocebus     139 RTALPALDSYTARALPLDPPPEPAPEPPFSPEEDPEPAPSLKLIPSVSSEAGPALGPFPAHTPLAANSS  207 

cons            139 *:*** **** * ** *..***** * *: ************************ **:*::** **:    207 


Homo            204 GPTLDFTFRADPSAIGLADPPIPSPVPSPILGTIPSAISLQNCTETFPSSSENFALDKRVLIRVTYCGL  272 
Pan             204 GPTLDFTFRADPSATGLADPPIPSPVPSPILGTIPSAISLQNSTETFPSSSENFALDKRVLIRVTYCGL  272 
Pongo           204 GPTLDFTFRADLSATGLADPPIPSPVPSPILGTTSSAISLQNSTENFASSSENFALDKRVLIRVTYCGL  272 
Macaque         204 ---------------------------------------------------------------------  203 
Chlorocebus     208 GPTLDFTFRADPSATGLADPHIPSPVPAPILGTIPSTLSLQNSTETLVSTSENFALDKRVLIRVTYCGL  276 

cons            208                                                                        276 


Homo            273 USYSLRYILLKKSLEQQFPNHLLFEEDRAAQATGEFEVFVNGRLVHSKKRGDGFVNESRLQKIVSVIDE  341 
Pan             273 USYSLRYILLKKSLEQQFPNHLLFEEDRAAQATGEFEVFVNGRLVHSKKRGDGFVNESRLQKIVSVIDE  341 
Pongo           273 USYSLRYILLKKSLEQQFPNHLLFEEDRAAQATGEFEVFVNGRLVHSKKRGDGFVNESTLQKIVSVIDE  341 
Macaque         204 ---------------------------------------------------------------------  203 
Chlorocebus     277 USYSLRYILLKNSLEQQFPNHLLFEEDRAAQATGEFEVFVNGRLVHSKKRGDGFVNESGLQKIVSVIYE  345 

cons            277                                                                        345 


Homo            342 EIKKR  346 
Pan             342 EIKKR  346 
Pongo           342 EIKKR  346 
Macaque         204 ----S  204 
Chlorocebus     346 EIKKR  350 

cons            346        350