T-COFFEE, Version_9.03.r1318 (2012-07-12 19:05:45 - Revision 1318 - Build 366)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=87
*
 BAD AVG GOOD
*
Human          :  89
Chimpanzee     :  89
Gorilla        :  89
Macaque        :  86
Mouse          :  89
Orangutan      :  83
Orangutan_1    :  83
Green_monkey   :  89
cons           :  87

Human              1 GTTGGAAC-----ATTAATGATGGAACATGGCCAAA   31 
Chimpanzee         1 GTTGGAAC-----ATTAATGATGGAACATGGCCAAA   31 
Gorilla            1 GTTGGAAC-----ATTAATGATGGAACATGGCCAAA   31 
Macaque            1 GGTAGAA---ACCATGGCTTCAGGCACATGACTGAA   33 
Mouse              1 GTTGGAGC-----ATTTATGACGGGACATGGCCAAA   31 
Orangutan          1 CGGGGAAGAAACCATGGCTTCAGGCACATGACTGAA   36 
Orangutan_1        1 CGGGGAAGAAACCATGGCTTCAGGCACATGACTGAA   36 
Green_monkey       1 GTTGGAAC-----ATTAATGATGGAACATGGCCAAA   31 

cons               1     **       **   *   ** ***** *  **   36 


Human             32 CTTCAGTCATGATCCTGAAGCCATGGTTT--CTT--   63 
Chimpanzee        32 CTTCAGTCATGATCCTGAAGCCATGGTTT--CTT--   63 
Gorilla           32 CTTCAGTCATGATCCTGAAGCCATGGTTT--CTT--   63 
Macaque           34 GTTTGGCCATGTTCCATCATTAATGTTCCAGCATCA   69 
Mouse             32 CTTCAGTCATGTGCCTGAAGCCATGGTTT--CTT--   63 
Orangutan         37 GTTTGGCCATGTTCCATCATTAACGT-------T--   63 
Orangutan_1       37 GTTTGGCCATGTTCCATCATTAATGT-------T--   63 
Green_monkey      32 CTTCAGTCATGTGCCTGAAGCCATGGTTT--CTT--   63 

cons              37  **  * ****  **   *   * *        *     72 


Human             64 CCCTG   68 
Chimpanzee        64 CCCTG   68 
Gorilla           64 CCCTG   68 
Macaque           70 CCAGG   74 
Mouse             64 CCCCT   68 
Orangutan         64 CCAAC   68 
Orangutan_1       64 CCAAC   68 
Green_monkey      64 CCCCG   68 

cons              73 **      77