Command line: [exonerate -m p2g --showtargetgff -q SPP00000032_1.0.fa -t SPP00000032_1.0.GL397334.1/GL397334.1.subseq]
Hostname: [upf-OptiPlex-755]

C4 Alignment:
------------
         Query: SPP00000032_1.0 # Protein # Selenophosphate synthetase 1 (SPS1) # Homo sapiens # Complete
        Target: GL397334.1:subseq(10695644,101175) dna:supercontig supercontig:Nleu1.0:GL397334.1:1:11707591:1 REF:[revcomp]
         Model: protein2genome:local
     Raw score: 1994
   Query range: 0 -> 392
  Target range: 51175 -> 49999

     1 : MetSerThrArgGluSerPheAsnProGluSerTyrGluLeuAspLysSerPheArgLeu :    20
         |||||||||||||||||||||||| !!|||||||||||||||||||||||||||||||||
         MetSerThrArgGluSerPheAsnSerGluSerTyrGluLeuAspLysSerPheArgLeu
 51175 : ATGTCTACGCGGGAGTCCTTTAACTCGGAAAGTTACGAATTGGACAAAAGCTTCCGGCTA : 51118

    21 : ThrArgPheThrGluLeuLysGlyThrGlyCysLysValProGlnAspValLeuGlnLys :    40
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
         ThrArgPheThrGluLeuLysGlyThrGlyCysLysValProGlnAspValLeuGlnLys
 51117 : ACCAGATTCACTGAACTGAAGGGCACAGGCTGCAAAGTGCCCCAAGATGTCCTGCAAAAA : 51058

    41 : LeuLeuGluSerLeuGlnGluAsnHisPheGlnGluAspGluGlnPheLeuGlyAlaVal :    60
         ||||||||||||||||||||||||:!!|||||||||||||||||||||||||||||||||
         LeuLeuGluSerLeuGlnGluAsnTyrPheGlnGluAspGluGlnPheLeuGlyAlaVal
 51057 : TTGCTGGAATCTTTACAGGAGAACTACTTCCAAGAAGATGAGCAGTTTCTGGGAGCCGTT : 50998

    61 : MetProArgLeuGlyIleGlyMetAspThrCysValIleProLeuArgHisGlyGlyLeu :    80
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||! !|||
         MetProArgLeuGlyIleGlyMetAspThrCysValIleProLeuArgHisGlyValLeu
 50997 : ATGCCAAGGCTTGGCATTGGAATGGATACTTGCGTCATTCCTTTGAGGCACGGTGTGCTT : 50938

    81 : SerLeuValGlnThrThrAspTyrIleTyrProIleValAspAspProTyrMetMetGly :   100
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
         SerLeuValGlnThrThrAspTyrIleTyrProIleValAspAspProTyrMetMetGly
 50937 : TCCTTGGTTCAAACCACAGATTACATTTACCCGATCGTAGACGACCCTTACATGATGGGC : 50878

   101 : ArgIleAlaCysAlaAsnValLeuSerAspLeuTyrAlaMetGlyValThrGluCysAsp :   120
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
         ArgIleAlaCysAlaAsnValLeuSerAspLeuTyrAlaMetGlyValThrGluCysAsp
 50877 : AGGATAGCATGTGCCAATGTCCTCAGTGACCTCTATGCAATGGGGGTCACGGAATGTGAC : 50818

   121 : AsnMetLeuMetLeuLeuGlyValSerAsnLysMetThrAspArgGluArgAspLysVal :   140
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
         AsnMetLeuMetLeuLeuGlyValSerAsnLysMetThrAspArgGluArgAspLysVal
 50817 : AATATGCTGATGCTCCTTGGAGTCAGTAATAAAATGACCGACAGGGAAAGGGATAAAGTG : 50758

   141 : MetProLeuIleIleGlnGlyPheLysAspAlaAlaGluGluAlaGlyThrSerValThr :   160
         |||||||||||||||!:!|||||||||||| !!||||||||||||||||||||||||! !
         MetProLeuIleIleArgGlyPheLysAspProAlaGluGluAlaGlyThrSerValMet
 50757 : ATGCCTCTGATTATCCGAGGTTTTAAAGACCCAGCTGAGGAAGCAGGAACGTCTGTAATG : 50698

   161 : GlyGlyGlnThrValLeuAsnProTrpIleValLeuGlyGlyValAlaThrThrValCys :   180
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
         GlyGlyGlnThrValLeuAsnProTrpIleValLeuGlyGlyValAlaThrThrValCys
 50697 : GGCGGCCAAACAGTACTAAACCCCTGGATTGTCCTGGGAGGAGTCGCTACCACTGTCTGC : 50638

   181 : GlnProAsnGluPheIleMetProAspAsnAlaValProGlyAspValLeuValLeuThr :   200
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
         GlnProAsnGluPheIleMetProAspAsnAlaValProGlyAspValLeuValLeuThr
 50637 : CAGCCCAATGAATTTATCATGCCAGACAATGCAGTGCCAGGGGACGTGCTGGTGTTGACA : 50578

   201 : LysProLeuGlyThrGlnValAlaValAlaValHisGlnTrpLeuAspIleProGluLys :   220
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
         LysProLeuGlyThrGlnValAlaValAlaValHisGlnTrpLeuAspIleProGluLys
 50577 : AAACCCCTGGGGACACAGGTGGCAGTGGCTGTGCACCAGTGGCTGGATATTCCTGAGAAA : 50518

   221 : TrpAsnLysIleLysLeuValValThrGlnGluAspValGluLeuAlaTyrGlnGluAla :   240
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
         TrpAsnLysIleLysLeuValValThrGlnGluAspValGluLeuAlaTyrGlnGluAla
 50517 : TGGAATAAGATTAAACTAGTGGTCACCCAAGAAGATGTAGAGCTGGCCTACCAGGAGGCG : 50458

   241 : MetMetAsnMetAlaArgLeuAsnArgThrAlaAlaGlyLeuMetHisThrPheAsnAla :   260
         |||||||||||||||! !||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
         MetMetAsnMetAlaMetLeuAsnArgThrAlaAlaGlyLeuMetHisThrPheAsnAla
 50457 : ATGATGAACATGGCGATGCTCAACAGGACAGCTGCAGGACTCATGCACACGTTCAATGCC : 50398

   261 : HisAlaAlaThrAspIleThrGlyPheGlyIleLeuGlyHisAlaGlnAsnLeuAlaLys :   280
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
         HisAlaAlaThrAspIleThrGlyPheGlyIleLeuGlyHisAlaGlnAsnLeuAlaLys
 50397 : CACGCCGCCACTGACATCACGGGCTTCGGGATTTTGGGCCATGCGCAGAACCTGGCCAAG : 50338

   281 : GlnGlnArgAsnGluValSerPheValIleHisAsnLeuProValLeuAlaLysMetAla :   300
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
         GlnGlnArgAsnGluValSerPheValIleHisAsnLeuProValLeuAlaLysMetAla
 50337 : CAGCAGAGGAACGAGGTGTCGTTTGTAATTCACAACCTCCCGGTGCTGGCCAAGATGGCT : 50278

   301 : AlaValSerLysAlaCysGlyAsnMetPheGlyLeuMetHisGlyThrCysProGluThr :   320
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.!!
         AlaValSerLysAlaCysGlyAsnMetPheGlyLeuMetHisGlyThrCysProGluAla
 50277 : GCGGTGAGCAAGGCCTGCGGAAACATGTTCGGCCTCATGCACGGGACCTGCCCGGAGGCT : 50218

   321 : SerGlyGlyLeuLeuIleCysLeuProArgGluGlnAlaAlaArgPheCysAlaGluIle :   340
         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:!!||||||||||||||||||
         SerGlyGlyLeuLeuIleCysLeuProArgGluGlnAlaSerArgPheCysAlaGluIle
 50217 : TCAGGCGGCCTTCTGATCTGTTTACCACGTGAGCAAGCATCTCGGTTCTGTGCAGAGATA : 50158

   341 : LysSerProLysTyrGlyGluGlyHisGlnAlaTrpIleIleGlyIleValGluLysGly :   360
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
         LysSerProLysTyrGlyGluGlyHisGlnAlaTrpIleIleGlyIleValGluLysGly
 50157 : AAGTCCCCCAAATATGGTGAAGGCCACCAAGCATGGATTATTGGGATTGTAGAGAAGGGC : 50098

   361 : AsnArgThrAlaArgIleIleAspLysProArgIleIleGluValAlaProGlnValAla :   380
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
         AsnArgThrAlaArgIleIleAspLysProArgIleIleGluValAlaProGlnValAla
 50097 : AACCGCACAGCGAGAATCATAGACAAACCCCGGATCATCGAGGTCGCACCACAAGTGGCC : 50038

   381 : ThrGlnAsnValAsnProThrProGlyAlaThrSer :   392
         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
         ThrGlnAsnValAsnProThrProGlyAlaThrSer
 50037 : ACTCAAAATGTGAATCCCACACCCGGGGCCACCTCT : 50000

vulgar: SPP00000032_1.0 0 392 . GL397334.1:subseq(10695644,101175) 51175 49999 - 1994 M 392 1176
# --- START OF GFF DUMP ---
#
#
##gff-version 2
##source-version exonerate:protein2genome:local 2.2.0
##date 2012-11-27
##type DNA
#
#
# seqname source feature start end score strand frame attributes
#
GL397334.1:subseq(10695644,101175)	exonerate:protein2genome:local	gene	50000	51175	1994	-	.	gene_id 1 ; sequence SPP00000032_1.0 ; gene_orientation .
GL397334.1:subseq(10695644,101175)	exonerate:protein2genome:local	cds	50000	51175	.	-	.	
GL397334.1:subseq(10695644,101175)	exonerate:protein2genome:local	exon	50000	51175	.	-	.	insertions 0 ; deletions 0
GL397334.1:subseq(10695644,101175)	exonerate:protein2genome:local	similarity	50000	51175	1994	-	.	alignment_id 1 ; Query SPP00000032_1.0 ; Align 51176 1 1176
# --- END OF GFF DUMP ---
#
-- completed exonerate analysis