T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=94
*
 BAD AVG GOOD
*
SPP00000092_1.0   :  94
PHYCAscaffold_1   :  94
cons              :  94
SPP00000092_1.0   MPINFNIGLLGHVDSGKTTLAKALSSISSTAAFDKNPQSVERGIT
PHYCAscaffold_1   --LNVNVGVLGHVDSGKTSLVRALSTQLSTAALDKHPQSQQRGIT
cons                :*.*:*:*********:*.:***:  ****:**:*** :****
SPP00000092_1.0   LDLGFSGLLVDAPAHLPQGEQLQFTFVDCPGHASLIRTIIGGAQI
PHYCAscaffold_1   LDLGFSSFLLKPSAQVK--PCLQVTLVDCPGHASLFRTILGGVAI
cons              ******.:*:...*::     **.*:*********:***:**. *
SPP00000092_1.0   IDLMLLVVDAQKGKQTQTAECLIIGELLQKKLI-VVINKIDVYPE
PHYCAscaffold_1   IDTVLLVIDCRKGLQAQTIESLLLATLIAKRSVVVALTKTDLVPS
cons              ** :***:*.:** *:** *.*::. *: *: : *.:.* *: *.
SPP00000092_1.0   NQRASKLEKLRLRLAKTLEATTFGG-------QVPICAVSALQGT
PHYCAscaffold_1   AERDNVIGKCSHE-VRSFMATNFNFHDTSSIPVVPVAVGSNQDPQ
cons               :* . : *   . .::: **.*.         **:.. *  :  
SPP00000092_1.0   HIAELREVLREAYFQPQRNLADPLFMYVDHCFGIKGQGTVCTGTL
PHYCAscaffold_1   GIPQLLEALNANLQVPERDHSGSFCLAVDHCFSVPGNGTILTGTV
cons               *.:* *.*.     *:*: :..: : *****.: *:**: ***:
SPP00000092_1.0   LQGKVQVNNVIELPALGEQRKVKSIQMFRKNVTSASMGDRIGLCV
PHYCAscaffold_1   LSGALERGDELELLPLGAKVKVKTLQVFKKDVAKCSQGDRVGLRV
cons              *.* :: .: :** .** : ***::*:*:*:*:..* ***:** *
SPP00000092_1.0   TQFNAKLLERGI-ITQPGYLKPIYAVCLQFKPIRYYKEV-IKSMR
PHYCAscaffold_1   NGLDPALVERALAVSPPGSLTPVTQVVIPVTKVPFFHEISCKSGG
cons              . ::. *:**.: :: ** *.*:  * : .. : :::*:  **  
SPP00000092_1.0   KMHISVGHNTVMANVTLFRDT---DGTTSTFQLDKEYEYMEDVQP
PHYCAscaffold_1   KCHVTVGHTTIIAMATFFTCLGGDKGDETGFNPSALYEYVEELSD
cons              * *::***.*::* .*:*      .*  : *: .  ***:*::. 
SPP00000092_1.0   AEVQHNDVIYALLQFESPVLSPPHSTLIASKLDMDVHSTSCRLAF
PHYCAscaffold_1   EKEAEEGMIFALLQFEQAVFCPPKTLVVCSRMDLDAKRFPCRLAF
cons               :  .:.:*:******..*:.**:: ::.*::*:*.:  .*****
SPP00000092_1.0   WGRIAWQTHSSKYFQEELPKLRIFKRKQKVGSIQRVVNSSEVIVQ
PHYCAscaffold_1   YGVIQGVVGSREKFTLRLFKLMALKPPKLKGKATGPGQSLKTTVK
cons              :* *   . * : *  .* **  :*  :  *.     :* :. *:
SPP00000092_1.0   NLFKDAKRDLYVGKNVELSTGEKGRIERTFGQTSKVAITFQDALS
PHYCAscaffold_1   AVEKDVESISIDSSALRLAEPKSGQIERLKGETTAAAKKKHTLLR
cons               : **.:     .. :.*:  :.*:***  *:*: .* . :  * 
SPP00000092_1.0   PETISNVKNVKVLLNCKKYVFNKQAGLFQ
PHYCAscaffold_1   KQLAFNMHSVKVRINLKKRQILTQREL-F
cons               :   *::.*** :* **  : .*  *