T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=94
*
 BAD AVG GOOD
*
SPP00000092_1.0   :  94
PHYCAscaffold_1   :  94
cons              :  94

SPP00000092_1.0   MPINFNIGLLGHVDSGKTTLAKALSSISSTAAFDKNPQSVERGIT
PHYCAscaffold_1   --LNVNVGVLGHVDSGKTSLVRALSTQLSTAALDKHPQSQQRGIT

cons                :*.*:*:*********:*.:***:  ****:**:*** :****


SPP00000092_1.0   LDLGFSGLLVDAPAHLPQGEQLQFTFVDCPGHASLIRTIIGGAQI
PHYCAscaffold_1   LDLGFSSFLLKPSAQVK--PCLQVTLVDCPGHASLFRTILGGVAI

cons              ******.:*:...*::     **.*:*********:***:**. *


SPP00000092_1.0   IDLMLLVVDAQKGKQTQTAECLIIGELLQKKLI-VVINKIDVYPE
PHYCAscaffold_1   IDTVLLVIDCRKGLQAQTIESLLLATLIAKRSVVVALTKTDLVPS

cons              ** :***:*.:** *:** *.*::. *: *: : *.:.* *: *.


SPP00000092_1.0   NQRASKLEKLRLRLAKTLEATTFGG-------QVPICAVSALQGT
PHYCAscaffold_1   AERDNVIGKCSHE-VRSFMATNFNFHDTSSIPVVPVAVGSNQDPQ

cons               :* . : *   . .::: **.*.         **:.. *   


SPP00000092_1.0   HIAELREVLREAYFQPQRNLADPLFMYVDHCFGIKGQGTVCTGTL
PHYCAscaffold_1   GIPQLLEALNANLQVPERDHSGSFCLAVDHCFSVPGNGTILTGTV

cons               *.:* *.*.     *:*: :..: : *****.: *:**: ***:


SPP00000092_1.0   LQGKVQVNNVIELPALGEQRKVKSIQMFRKNVTSASMGDRIGLCV
PHYCAscaffold_1   LSGALERGDELELLPLGAKVKVKTLQVFKKDVAKCSQGDRVGLRV

cons              *.* :: .: :** .** : ***::*:*:*:*:..* ***:** *


SPP00000092_1.0   TQFNAKLLERGI-ITQPGYLKPIYAVCLQFKPIRYYKEV-IKSMR
PHYCAscaffold_1   NGLDPALVERALAVSPPGSLTPVTQVVIPVTKVPFFHEISCKSGG

cons              . ::. *:**.: :: ** *.*:  * : .. : :::*:  **  


SPP00000092_1.0   KMHISVGHNTVMANVTLFRDT---DGTTSTFQLDKEYEYMEDVQP
PHYCAscaffold_1   KCHVTVGHTTIIAMATFFTCLGGDKGDETGFNPSALYEYVEELSD

cons              * *::***.*::* .*:*      .*  : *: .  ***:*::. 


SPP00000092_1.0   AEVQHNDVIYALLQFESPVLSPPHSTLIASKLDMDVHSTSCRLAF
PHYCAscaffold_1   EKEAEEGMIFALLQFEQAVFCPPKTLVVCSRMDLDAKRFPCRLAF

cons               :  .:.:*:******..*:.**:: ::.*::*:*.:  .*****


SPP00000092_1.0   WGRIAWQTHSSKYFQEELPKLRIFKRKQKVGSIQRVVNSSEVIVQ
PHYCAscaffold_1   YGVIQGVVGSREKFTLRLFKLMALKPPKLKGKATGPGQSLKTTVK

cons              :* *   . * : *  .* **  :*  :  *.     :* :. *:


SPP00000092_1.0   NLFKDAKRDLYVGKNVELSTGEKGRIERTFGQTSKVAITFQDALS
PHYCAscaffold_1   AVEKDVESISIDSSALRLAEPKSGQIERLKGETTAAAKKKHTLLR

cons               : **.:     .. :.*:  :.*:***  *:*: .* . :  * 


SPP00000092_1.0   PETISNVKNVKVLLNCKKYVFNKQAGLFQ
PHYCAscaffold_1   KQLAFNMHSVKVRINLKKRQILTQREL-F

cons               :   *::.*** :* **  : .*  *