T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=88
*
 BAD AVG GOOD
*
gi|66814240|ref   :  88
Lt_contig6577_s   :  88
cons              :  88

gi|66814240|ref   MNLKNLETCKGLIKGSYIDQAIQGTSQFNKLLETLLIHKKLPNIG
Lt_contig6577_s   MDDRSLKLAEDFVPARYIDAGGESLRSTARILRCILAQRRCPDEA

cons              *: :.*: .:.:: . *** . :.  .  ::*. :* ::: *: .


gi|66814240|ref   YNDKIIELILNEISLMDSNNFIENIGVGEREGRIYSGLVEKRHYG
Lt_contig6577_s   LTDAAIELILRQLSLMDTNNFAHHVGGGEREGRVVSALVRMRHFH

cons               .*  *****.::****:*** .::* ******: *.**. **: 


gi|66814240|ref   FAHGIGRSGDITEQQPKAAGSSLIQKLTHSLVLDAMKLAGLEQSS
Lt_contig6577_s   LTHGIGRSGDLFSEQPKAAGSSLLYKITNVLMLDLLRQAGAPS--

cons              ::********: .:*********: *:*: *:** :: **  .  


gi|66814240|ref   LSNCLLLPMATGMTLALTMLTLKSI--------NANNKRYVLWPR
Lt_contig6577_s   TAAAVVVPMSTGMTLALVLREADRAGHDRTSLLVPATPRYVIWPR

cons               : .:::**:*******.:   .           . . ***:***


gi|66814240|ref   IDQKSCLKSIITAGLIPIVIPNQL---DGDMIRTDLVAIEDKIKE
Lt_contig6577_s   IDQKTALKCIDAAGLIPV--PVQLXGCDTRTLCRSLAAAVNAVG-

cons              ****:.**.* :*****:  * **   *   :  .*.*  : :  


gi|66814240|ref   LGVDNILCVFSTTSCFAPRVPDKIIEISEICKRYNIGHIINNAYG
Lt_contig6577_s   -GPSQVVCVLSTTSCFAPRLPDNTVGIAQYCKEAGIPYVVNNAYG

cons               * .:::**:*********:**: : *:: **. .* :::*****


gi|66814240|ref   LQCSKILHNISQACKLGRVDAFIQSTDKNFMVPVGGAIISGPNSE
Lt_contig6577_s   VQSRRIMTRLDAAQRLGRVDFVVQSGDKNFLVPVGGSIISSSDKA

cons              :*. :*: .:. * :***** .:** ****:*****:***..:. 


gi|66814240|ref   FIDQISRNYPGRANSSPILDVFITLLSMGKQGWLNLLKERKELLI
Lt_contig6577_s   RCQAVAALYAGRASMSPIVDLFITALSLGRRGMQALWSDRYRCRA

cons                : ::  *.***. ***:*:*** **:*::*   * .:* .   


gi|66814240|ref   YFNEQLSKFALENNEKLLNTINENK---ISFALTLSSNNFNNNEE
Lt_contig6577_s   RLIRQLREFARERREVLLVDDTDDKADTVSGSKTIPGTVTARNDI

cons               : .** :** *..* **   .::*   :* : *:...   .*: 


gi|66814240|ref   IISNNNNNNNNTFSMIGSKLFSR-SCSGSRVIDLKSNKKLLIGGL
Lt_contig6577_s   SVAVTMRTYGLPTAKVGSSGVQRDAVTGPRVITPAPSTPTTIAGC

cons               :: . .. . . : :**. ..* : :*.***   ...   *.* 


gi|66814240|ref   EFNNYGSHIDNYST-SYLTVACAIGITKLEIDTFIQRLSKLFNKK
Lt_contig6577_s   TFRNYGMHQDWAPPCPLLVIACGIGMSEAEVDALMARLRDL---W

cons               *.*** * *  .. . *.:**.**::: *:*::: ** .*