T-COFFEE, Version_7.54(Tue Jan 13 18:15:23 WEST 2009)
Cedric Notredame 
CPU TIME:0 sec.
SCORE=89
*
 BAD AVG GOOD
*
gi|66814240|ref   :  89
contig_09_subse   :  89
cons              :  89

gi|66814240|ref   MNLKNLETCKGLIKGSYIDQAIQGTSQFNKLLETLLIHKKLPNIG
contig_09_subse   MDDRSLKLAEDFVSARYIEAGRESLRATARIMRSILAQRCCPDEG

cons              *: :.*: .:.::.. **: . :.     :::.::* ::  *: *


gi|66814240|ref   YNDKIIELILNEISLMDSNNFIENIGVGEREGRIYSGLVEKRHYG
contig_09_subse   LTDAAIELILRQLSLMDTNNLAHHVGGGEREGRVVSALVRMRHFH

cons               .*  *****.::****:**: .::* ******: *.**. **: 


gi|66814240|ref   FAHGIGRSGDITEQQPKAAGSSLIQKLTHSLVLDAMKLAGLEQSS
contig_09_subse   LTHGIGRSGDLFSEQPKAAGSSLLYKITNVLMLDLIRQAGAPS--

cons              ::********: .:*********: *:*: *:** :: **  .  


gi|66814240|ref   LSNCLLLPMATGMTLALTMLTLKS-IN-ANNKRYVLWPRIDQKSC
contig_09_subse   TAAAVVVPMATGMTLALVLRHDRTSLPVPATPRYVIWPRIDQKTA

cons               : .:::**********.:   :: :  . . ***:*******:.


gi|66814240|ref   LKSIITAGLIPIVIPNQLDGDMIRTDLVA--IEDKIKELGVDNI-
contig_09_subse   LKCIDAAGLVPVPVQLRPAVPLARSAAPCVSTNRDSLDRGQDSIG

cons              **.* :***:*: :  :    : *:   .   : .  : * *.* 


gi|66814240|ref   -LCVFSTTSCFAPRVPDKIIEISEICKRYNIGHIINNAYGLQCSK
contig_09_subse   XVCVLSTTSCFAPRLPDNTVAIAQYCKKAGIPYVVNNAYGVQSRR

cons               :**:*********:**: : *:: **: .* :::*****:*. :


gi|66814240|ref   ILHNISQACKLGRVDAFIQSTDKNFMVPVGGAIISGPNSEFIDQI
contig_09_subse   IMTRLDAAQRLGRVDFVVQSGDKNFLVPVGGSIICSGDKERCKAV

cons              *: .:. * :***** .:** ****:*****:**.. :.*  . :


gi|66814240|ref   SRNYPGRANSSPILDVFITLLSMGKQGWLNLLKERKELLIYFNEQ
contig_09_subse   AALYAGRASMSPIVDLFITALSLGRRGMQTLWSDRYKCRARLIRQ

cons              :  *.***. ***:*:*** **:*::*  .* .:* :    : .*


gi|66814240|ref   LSKFALENNEKLLNTINE-NKISFALTLSSNNFNNNEEIISNNNN
contig_09_subse   LRVFARERREVLLVDDSDDDKADEDTVASSSGAQLGSEQAG--RV

cons              *  ** *..* **   .: :* .   . **.. : ..*  .  . 


gi|66814240|ref   NNNNTFSMIGSKLFSRSCSGSRVIDLKSNKKLLIGGLEFNNYGSH
contig_09_subse   TNWAAARALGAQLFRSAVTGPRVITPAPSTPTTIAGCTFRNYGMH

cons              .*  :   :*::**  : :*.***   ...   *.*  *.*** *


gi|66814240|ref   IDNYST-SYLTVACAIGITKLEIDTFIQRLSKLFNKK
contig_09_subse   QDREPPCPLLVIACGIGMSESEVDALMARLRDL---W

cons               *. .. . *.:**.**::: *:*::: ** .*